RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 VAMP8Q9BV40 100 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 TNXBP22105 4242 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 PRYO14603 147 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR1AP35321 89 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 A6NJY4 79 aa6.58□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-8P60410 259 aa6.58□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.58□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.57□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.57□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 HERC1Q15751 4861 aa6.56□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.56□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 B5MCH6 92 aa6.56□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ERC2-IT1O76042 136 aa6.56□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 IFITM1P13164 125 aa6.56□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.56□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087X002 238 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 A4D1N5 150 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 DLEU1O43261 78 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZVH6 145 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 C12orf57Q99622 126 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 Q9BRP9 147 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.54□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 HIST1H4GQ99525 98 aa6.54□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 A6NDN8 102 aa6.53□□□□□ -1.36
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZRX8 168 aa6.52□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.52□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.52□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 C6orf99Q4VX62 202 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 HIGD1BQ9P298 99 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 S100A12P80511 92 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 COPS9Q8WXC6 57 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR4Q96PI1 79 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PRO1933Q9H354 126 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.47□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CRYGAP11844 174 aa6.47□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 COX7BP24311 80 aa6.47□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 FXYD2P54710 66 aa6.47□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.47□□□□□ -1.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CFC1BP0CG36 223 aa6.46□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 CFC1P0CG37 223 aa6.46□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 CEND1Q8N111 149 aa6.46□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.45□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 H7C2G1 150 aa6.45□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.45□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.45□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.44□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.44□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPAN13O95857 204 aa6.43□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00483Q53H64 154 aa6.43□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 K7ERJ3 54 aa6.42□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM6P0DI80 62 aa6.42□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 TAL2Q16559 108 aa6.42□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.42□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.41□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GWB2 263 aa6.41□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 HSD52Q0P140 79 aa6.41□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.41□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 RAB37Q96AX2 223 aa6.41□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.41□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.4□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0B4J2C4 111 aa6.4□□□□□ -1.38
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 MOBPQ13875 183 aa6.39□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.38□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00575Q6W349 94 aa6.38□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8NBF4 154 aa6.38□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.37□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 CTAG1AP78358 180 aa6.37□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.37□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.37□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.37□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR1BP22528 89 aa6.36□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 Q1RN00 199 aa6.36□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM29Q86T20 159 aa6.36□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0G2JQZ4 141 aa6.35□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.35□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 VAMP3Q15836 100 aa6.35□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N377 158 aa6.35□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.35□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.34□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZQY7 126 aa6.34□□□□□ -1.39
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms