RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PET117Q6UWS5 81 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q9BRP9 147 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC01545Q5VT33 79 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MUC2Q02817 5179 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LITAFQ99732 161 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV6-57P01721 117 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFC2O95298 119 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00483Q53H64 154 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MUC17Q685J3 4493 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C3orf79P0CE67 100 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8NBF4 154 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZRX8 168 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF815PA8K554 130 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTAG1AP78358 180 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A12P80511 92 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTDAPP60985 99 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MOBPQ13875 183 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TPRXLQ17RH7 258 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TIMM17BO60830 172 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPANXCQ9NY87 97 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATOH7Q8N100 152 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPINK1P00995 79 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCP2Q8IVA1 136 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8N377 158 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C20orf202A1L168 122 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C6orf99Q4VX62 202 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPRR1BP22528 89 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COX7BP24311 80 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A4D1N5 150 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C5orf52A6NGY3 159 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFITM1P13164 125 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A0U1RQV1 116 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC25A20O43772 301 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A6NDN8 102 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q1RN00 199 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZVH6 145 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM29Q86T20 159 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A0G2JQZ4 141 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A1B0GWB2 263 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAL2Q16559 108 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COPS9Q8WXC6 57 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A2P29034 98 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AKR1D1P51857 326 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 XP32Q5T750 250 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A1P23297 94 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCP4P48539 62 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H3BS24 57 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H7C2G1 150 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCE2CQ5TA81 110 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LIMD2Q9BT23 127 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRO1933Q9H354 126 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms