RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439875.1

FAM225B-202, Transcript of family with sequence similarity 225 member B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM225B, Length 7,380 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM225B-202ENST00000439875 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.92□□□□□ -1.3
FAM225B-202ENST00000439875 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.92□□□□□ -1.3
FAM225B-202ENST00000439875 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.91□□□□□ -1.3
FAM225B-202ENST00000439875 DSCR10P59022 87 aa6.91□□□□□ -1.3
FAM225B-202ENST00000439875 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.91□□□□□ -1.3
FAM225B-202ENST00000439875 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.91□□□□□ -1.3
FAM225B-202ENST00000439875 Q6ZQT0 140 aa6.9□□□□□ -1.3
FAM225B-202ENST00000439875 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.9□□□□□ -1.3
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FAM225B-202ENST00000439875 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.89□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.89□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.89□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 A0A1W2PNN7 141 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 A8MWP4 228 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 CEP350Q5VT06 3117 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.88□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.88□□□□□ -1.31
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FAM225B-202ENST00000439875 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.87□□□□□ -1.31
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FAM225B-202ENST00000439875 IGFL1Q6UW32 110 aa6.84□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.84□□□□□ -1.31
FAM225B-202ENST00000439875 H3BPC8 53 aa6.83□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.82□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 M0R2T5 61 aa6.81□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 SPRR4Q96PI1 79 aa6.8□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.8□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 Q6ZSA8 131 aa6.79□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.79□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 A0A1B0GVX0 72 aa6.79□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 K7EQZ3 153 aa6.78□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.78□□□□□ -1.32
FAM225B-202ENST00000439875 BPTFQ12830 3046 aa6.77□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 Q8N377 158 aa6.77□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 LITAFQ99732 161 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 WIPF1O43516 503 aa6.76□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 LCE6AA0A183 80 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.75□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 A0A0G2JQZ4 141 aa6.74□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.73□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 PRR15Q8IV56 129 aa6.72□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 Q5VSD8 79 aa6.72□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 CRIPTQ9P021 101 aa6.72□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.71□□□□□ -1.33
FAM225B-202ENST00000439875 ERC2-IT1O76042 136 aa6.7□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 ITPR3Q14573 2671 aa6.69□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 LINC01600Q96MT4 127 aa6.68□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 LINC01554Q52M75 96 aa6.67□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 CD164Q04900 197 aa6.65□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 PRO0461Q9UI25 63 aa6.65□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.65□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 USP24Q9UPU5 2620 aa6.65□□□□□ -1.34
FAM225B-202ENST00000439875 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.65□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.64□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 COA5Q86WW8 74 aa6.61□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 UQCR11O14957 56 aa6.61□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 HTTP42858 3142 aa6.6□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 Q8N1X5 172 aa6.6□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.6□□□□□ -1.35
FAM225B-202ENST00000439875 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.56□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 A0A0D9SG42 100 aa6.56□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.56□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.56□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP10-1P60331 282 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 BRCA2P51587 3418 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 PRO0628Q9UI54 55 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 LAMA3Q16787 3333 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP10-2P60368 255 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 OXTP01178 125 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 C4orf26Q17RF5 130 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 A0A1W2PNM2 257 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM225B-202ENST00000439875 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.5□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.5□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 FAM104AQ969W3 186 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 LINC00483Q53H64 154 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 TRANK1O15050 2925 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 LUZP6Q538Z0 58 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 S4R3F8 94 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 ATRQ13535 2644 aa6.46□□□□□ -1.37
FAM225B-202ENST00000439875 HRES1P13985 223 aa6.45□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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