RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 Q1RN00 199 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 SFTA2Q6UW10 78 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 C5orf52A6NGY3 159 aa5.86□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 ATP6V1G1O75348 118 aa5.86□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 LINC01546A6NGU7 62 aa5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 C11orf86A6NJI1 115 aa5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 NDUFA6P56556 154 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 PRO1933Q9H354 126 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.83□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 NDUFA5Q16718 116 aa5.83□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.83□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.83□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 LINC01549A6NIU2 74 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.81□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 IFITM2Q01629 132 aa5.81□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.81□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 AKR1D1P51857 326 aa5.8□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.79□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.79□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 PCP2Q8IVA1 136 aa5.79□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 A0A096LNJ9 63 aa5.78□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM223A0PJW6 202 aa5.78□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 FA2HQ7L5A8 372 aa5.78□□□□□ -1.48
DDX39B-208ENST00000428098 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.77□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 FAM236CP0DP71 79 aa5.77□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.77□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.77□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP5-9P26371 169 aa5.76□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 BAGE3Q86Y29 109 aa5.76□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.75□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 S100A1P23297 94 aa5.75□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.75□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 TCL1BO95988 128 aa5.74□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 HERV-K104P63124 156 aa5.74□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 TAL2Q16559 108 aa5.74□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 Q96NJ1 140 aa5.74□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 PEA15Q15121 130 aa5.73□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 C6orf99Q4VX62 202 aa5.73□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.73□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00587B1AMM8 73 aa5.72□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 CLLU1Q5K131 121 aa5.72□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.72□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.72□□□□□ -1.49
DDX39B-208ENST00000428098 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.71□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 NDUFC2O95298 119 aa5.71□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 A8MUU9 505 aa5.7□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 HRES1P13985 223 aa5.7□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.7□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 HBDP02042 147 aa5.69□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 PMCHL1Q16048 86 aa5.69□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.69□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.69□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.69□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.68□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 IGFL1Q6UW32 110 aa5.68□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 COMMD7Q86VX2 200 aa5.68□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.68□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.67□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 MT-ND4LP03901 98 aa5.67□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.67□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.66□□□□□ -1.5
DDX39B-208ENST00000428098 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 NPC2P61916 151 aa5.64□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.64□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.64□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.63□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 A6NN06 94 aa5.63□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 COX7BP24311 80 aa5.63□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.63□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 Q6ZVH6 145 aa5.63□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00614P0C842 121 aa5.62□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 UQCC3Q6UW78 93 aa5.62□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 RHEBQ15382 184 aa5.61□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 LCE1DQ5T752 114 aa5.61□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.61□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.61□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.6□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.6□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.6□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.59□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 A8MWP4 228 aa5.59□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.59□□□□□ -1.51
DDX39B-208ENST00000428098 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.58□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 LEPROTO15243 131 aa5.57□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.57□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM218A2RU14 115 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms