RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C5orf52A6NGY3 159 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRR4Q96PI1 79 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q9BRP9 147 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERC2-IT1O76042 136 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZRX8 168 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LPAP08519 4548 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPAN13O95857 204 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFITM1P13164 125 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZVH6 145 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCGB1D1O95968 90 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00483Q53H64 154 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00304Q8N9R0 145 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COPS9Q8WXC6 57 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRR4Q16378 134 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C6orf99Q4VX62 202 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A6NDN8 102 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COX8AP10176 69 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COX7BP24311 80 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q8NBF4 154 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF213Q63HN8 5207 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTAG1AP78358 180 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MOBPQ13875 183 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPAG11AQ6PDA7 123 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A4D1N5 150 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DLEU1O43261 78 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C14orf144Q96I85 54 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRR1BP22528 89 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA45Q537H7 98 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1B0GWB2 263 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H4GQ99525 98 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VAMP8Q9BV40 100 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPINK1P00995 79 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C12orf57Q99622 126 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEFB105AQ8NG35 78 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIGD1BQ9P298 99 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PYY3Q5JQD4 70 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAL2Q16559 108 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM29Q86T20 159 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q1RN00 199 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFC1BP0CG36 223 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFC1P0CG37 223 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VAMP3Q15836 100 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00575Q6W349 94 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q8N377 158 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPRXLQ17RH7 258 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A20O43772 301 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEND1Q8N111 149 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0B4J2C4 111 aa14.06□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 hADV29S1A0JD25 119 aa14.06□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H7C2G1 150 aa14.06□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC17Q685J3 4493 aa14.06□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC2Q02817 5179 aa14.05□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.05□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAB37Q96AX2 223 aa14.05□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.03□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZQY7 126 aa14.03□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRO1933Q9H354 126 aa14.03□□□□□ -0.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FXYD2P54710 66 aa14.02□□□□□ -0.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDIP1Q9H305 208 aa14.02□□□□□ -0.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0G2JQZ4 141 aa14.01□□□□□ -0.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms