RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 Q6Q795 121 aa1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 TSKUQ8WUA8 353 aa1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 C20orf78Q9BR46 151 aa1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 DPH3P1Q9H4G8 78 aa1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SPANXCQ9NY87 97 aa1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SS18L2Q9UHA2 77 aa1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa1.19□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1B0GUT8 65 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf196B1AJZ1 125 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 H3BVH4 76 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 I3L3M4 83 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 ANGP03950 147 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 IGLC6P0CF74 106 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 CNBPP62633 177 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 RHEBQ15382 184 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF56Q15929 161 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 FAM74A4Q5TZK3 123 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 Q6ZSA8 131 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 WFDC10BQ8IUB3 73 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SPACA4Q8TDM5 124 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM191AQ9H0A3 160 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 OSTCQ9NRP0 149 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 NAT8BQ9UHF3 227 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SACSQ9NZJ4 4579 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV3-30P01768 117 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV3-33P01772 117 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SEC11AP67812 179 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01554Q52M75 96 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 LYRM7Q5U5X0 104 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 LCA10Q71F78 164 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 C9orf163Q8N9P6 203 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 OR10AG1Q8NH19 301 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 DPH3Q96FX2 82 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 TIMM21Q9BVV7 248 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 ST20Q9HBF5 79 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 BIRC6Q9NR09 4857 aa1.18□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 RYR2Q92736 4967 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF727A8MUV8 499 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 HIGD1CA8MV81 97 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 MT-ND4LP03901 98 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 FCER1GP30273 86 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 ENHOQ6UWT2 76 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00269Q8N2A0 174 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 OR5A1Q8NGJ0 315 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SMIM7Q9BQ49 75 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 IMUPQ9GZP8 106 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM242Q9NWH2 141 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 DNAH5Q8TE73 4624 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 VPS13DQ5THJ4 4388 aa1.17□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 C7orf77A4D0Y5 90 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 J3QQQ9 107 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 CKS2P33552 79 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 HBBP68871 147 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SFTA2Q6UW10 78 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 MGPP08493 103 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 FXYD2P54710 66 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 Q5VSD8 79 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SPINK6Q6UWN8 80 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 ALKAL2Q6UX46 152 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHB2Q96CS7 222 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SCGB3A1Q96QR1 104 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 C2orf88Q9BSF0 95 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 PLAC8Q9NZF1 115 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 V9GYV3 84 aa1.16□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 DNAH2Q9P225 4427 aa1.15□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 FRAS1Q86XX4 4008 aa1.15□□□□□ -2.22
CCDC82-202ENST00000423339 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00587B1AMM8 73 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 S100PP25815 95 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 NUP35Q8NFH5 326 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM141Q96I45 108 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 DNAH11Q96DT5 4516 aa1.15□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 FAT2Q9NYQ8 4349 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 MT-ND6P03923 174 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms