RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.52□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.51□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFC2O95298 119 aa8.5□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT2AP02795 61 aa8.5□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM29Q86T20 159 aa8.5□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.5□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.5□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COMMD7Q86VX2 200 aa8.48□□□□□ -1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.48□□□□□ -1.05
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX19Q49B96 90 aa8.47□□□□□ -1.05
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMCHL1Q16048 86 aa8.45□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q1RN00 199 aa8.45□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.45□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.45□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFITM2Q01629 132 aa8.44□□□□□ -1.06
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100PP25815 95 aa8.43□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAL2Q16559 108 aa8.43□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q75L30 129 aa8.43□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.43□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCL1BO95988 128 aa8.42□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC11CQ9BY50 192 aa8.42□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.41□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP10-10P60014 251 aa8.41□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.41□□□□□ -1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.4□□□□□ -1.06
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.39□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.38□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHEBQ15382 184 aa8.36□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCP2Q8IVA1 136 aa8.36□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.36□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.36□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LEPROTO15243 131 aa8.35□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.35□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.34□□□□□ -1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NMUP48645 174 aa8.33□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0G2JQZ4 141 aa8.32□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX7BP24311 80 aa8.32□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.32□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.32□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 J3QQQ9 107 aa8.31□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPC2P61916 151 aa8.3□□□□□ -1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C6orf99Q4VX62 202 aa8.3□□□□□ -1.08
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.28□□□□□ -1.08
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.27□□□□□ -1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPANXCQ9NY87 97 aa8.27□□□□□ -1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.26□□□□□ -1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.26□□□□□ -1.09
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.25□□□□□ -1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0Y8G0 127 aa8.21□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM218A2RU14 115 aa8.2□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGFL1Q6UW32 110 aa8.19□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.19□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GWB2 263 aa8.18□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F8WEM9 126 aa8.18□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.18□□□□□ -1.1
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 UQCC3Q6UW78 93 aa8.17□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.17□□□□□ -1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEBP20929 6669 aa8.17□□□□□ -1.1
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSBP1O75506 76 aa8.14□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6JHZ5 121 aa8.14□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A4D1N5 150 aa8.12□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC2BQ92478 149 aa8.12□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LITAFQ99732 161 aa8.12□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LST1O00453 97 aa8.11□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIMM17BO60830 172 aa8.11□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKCP01834 107 aa8.11□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LEPROTL1O95214 131 aa8.1□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLLU1Q5K131 121 aa8.1□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.1□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF815PA8K554 130 aa8.09□□□□□ -1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 E9PLD3 99 aa8.08□□□□□ -1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.07□□□□□ -1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.05□□□□□ -1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HRES1P13985 223 aa8.05□□□□□ -1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.04□□□□□ -1.12
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