RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C15orf56Q8N910 161 aa3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.55□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATOX1O00244 68 aa3.54□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COX7BP24311 80 aa3.54□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYCNQ0VAF6 134 aa3.54□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q8NDZ9 215 aa3.54□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.54□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCR3O14931 201 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZQT0 140 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRAPQ8TCY5 172 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DSCR8Q96T75 97 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBL5Q9BZL1 73 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00846Q9NV44 126 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAST4O15021 2626 aa3.53□□□□□ -1.84
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.52□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UQCRQO14949 82 aa3.52□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZRU5 148 aa3.52□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RETNQ9HD89 108 aa3.52□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.52□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRYO14603 147 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPRR1AP35321 89 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CXCL6P80162 114 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZQY7 126 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZRP5 223 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.51□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STAB1Q9NY15 2570 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CRYGAP11844 174 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C14orf177Q52M58 125 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.5□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.49□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.49□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 K7EIL1 84 aa3.49□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COX7CP15954 63 aa3.49□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.49□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL6A5A8TX70 2615 aa3.48□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.48□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP17L23D6RBM5 183 aa3.48□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZRX8 168 aa3.48□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SERP2Q8N6R1 65 aa3.48□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.48□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.47□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.47□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C7orf33Q8WU49 177 aa3.47□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 B9D2Q9BPU9 175 aa3.47□□□□□ -1.85
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BAHCC1Q9P281 2608 aa3.46□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TENM3Q9P273 2699 aa3.46□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C16orf90A8MZG2 172 aa3.46□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H0Y9J4 135 aa3.46□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC179H3BU77 68 aa3.46□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZVQ6 151 aa3.46□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NOTCH1P46531 2555 aa3.45□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.45□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.45□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERC2-IT1O76042 136 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q8N377 158 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPRR4Q96PI1 79 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 APLNQ9ULZ1 77 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.44□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.43□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.43□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUPR2A6NF83 97 aa3.43□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EPM2AB3EWF7 344 aa3.43□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM258P61165 79 aa3.43□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NREPQ16612 68 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms