RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.53□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A087WZ39 114 aa6.52□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A096LNI7 61 aa6.52□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLEC2BQ92478 149 aa6.52□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DAND5Q8N907 189 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C2orf48Q96LS8 159 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A087WYN8 130 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SNCGO76070 127 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6Q795 121 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX7B2Q8TF08 81 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DPH3Q96FX2 82 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRACP01848 142 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GAGE2BQ13066 116 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIAA0087Q14695 138 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C10orf25Q5T742 122 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GAGE2EQ4V326 116 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYCBP2O75592 4640 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A0U1RRA0 63 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 F8WDY8 70 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ACYP1P07311 99 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q8IZM0 81 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZRP5 223 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1W2PNN7 141 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00158P58513 81 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C7orf33Q8WU49 177 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM168BA1KXE4 195 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H0YGX0 51 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CXCL5P42830 114 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV2D-28P01615 120 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNAL4O96015 105 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IMUPQ9GZP8 106 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00643Q86TS7 51 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PFN2P35080 140 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C22orf24Q9Y442 160 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HERC1Q15751 4861 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GX51 115 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFC2O95298 119 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX17Q14061 63 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00167Q96N53 147 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC179H3BU77 68 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBE2BP63146 152 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C1orf137Q5JT78 98 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms