RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.67□□□□□ -1.34
LRRTM4-202ENST00000409093 C10orf25Q5T742 122 aa6.67□□□□□ -1.34
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.67□□□□□ -1.34
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.67□□□□□ -1.34
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.66□□□□□ -1.34
LRRTM4-202ENST00000409093 Q9HAA7 133 aa6.66□□□□□ -1.34
LRRTM4-202ENST00000409093 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.66□□□□□ -1.34
LRRTM4-202ENST00000409093 VPREB1P12018 145 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFC1O43677 76 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 C15orf56Q8N910 161 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 MUC7Q8TAX7 377 aa6.63□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.63□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 A8MU10 97 aa6.61□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.61□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 BCE1O60756 84 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 Q6ZVQ6 151 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 NCR3O14931 201 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFS5O43920 106 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 Q1T7F1 81 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 APLNQ9ULZ1 77 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM4-202ENST00000409093 Q6ZRP5 223 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 Q8NDZ9 215 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 PSPHP1O15172 72 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 LYSTQ99698 3801 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 SYCNQ0VAF6 134 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 NUPR2A6NF83 97 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 CASC10Q5T4H9 136 aa6.57□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 A8MUN3 132 aa6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 H0YGX0 51 aa6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 UBE2BP63146 152 aa6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.55□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A087WYN8 130 aa6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 TENM2Q9NT68 2774 aa6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 LECT2O14960 151 aa6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.53□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.53□□□□□ -1.36
LRRTM4-202ENST00000409093 DNHD1Q96M86 4753 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV6-57P01721 117 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 SLPIP03973 132 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 C6orf99Q4VX62 202 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 PSCAO43653 123 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 LCA10Q71F78 164 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 hDV103S1A0JD37 113 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 A6NN06 94 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 C16orf90A8MZG2 172 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 DIRC1Q969H9 104 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 Q8N814 137 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00575Q6W349 94 aa6.46□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.46□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 PRYO14603 147 aa6.45□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00167Q96N53 147 aa6.45□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 UBL5Q9BZL1 73 aa6.45□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.45□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 C14orf177Q52M58 125 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 Q5VV11 94 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM168BA1KXE4 195 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 COX7BP24311 80 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 UBE2AP49459 152 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 NREPQ16612 68 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 FBN3Q75N90 2809 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 C7orf33Q8WU49 177 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRTM4-202ENST00000409093 HCG22E2RYF7 251 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms