RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 UQCRQO14949 82 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-202ENST00000398743 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-202ENST00000398743 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.96□□□□□ -0.97
PRAME-202ENST00000398743 FAM168BA1KXE4 195 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 COX7CP15954 63 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 LYSTQ99698 3801 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 PRYO14603 147 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZVQ6 151 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZRX8 168 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 SPRR1AP35321 89 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 HAMPP81172 84 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
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PRAME-202ENST00000398743 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.9□□□□□ -0.98
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PRAME-202ENST00000398743 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-202ENST00000398743 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.9□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 SERP2Q8N6R1 65 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 CXCL6P80162 114 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 Q8N377 158 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 Q9BRP9 147 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 COL7A1Q02388 2944 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 PSCAO43653 123 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 APLNQ9ULZ1 77 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 CRYGAP11844 174 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
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PRAME-202ENST00000398743 B9D2Q9BPU9 175 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 MDFIQ99750 246 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 C16orf90A8MZG2 172 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 SVIPQ8NHG7 77 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-202ENST00000398743 A0A096LNI7 61 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 REG3GQ6UW15 175 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 UBE2BP63146 152 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 C14orf177Q52M58 125 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 SCXQ7RTU7 201 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 ERC2-IT1O76042 136 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 C3orf84H3BNL1 204 aa8.79□□□□□ -1
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PRAME-202ENST00000398743 TNP2Q05952 138 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 NREPQ16612 68 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -13e-10■□□□□ 9.6
PRAME-202ENST00000398743 A0A1W2PNN7 141 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 C1orf137Q5JT78 98 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GW54 56 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 NUPR2A6NF83 97 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 A0A1W2PNM2 257 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 BPY2O14599 106 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 TMEM258P61165 79 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 Q8NBF4 154 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 PRLHP81277 87 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 CHTF8P0CG12 524 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 SMIM29Q86T20 159 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 F8WEM9 126 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 Q8N9L7 120 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 SPRR4Q96PI1 79 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-202ENST00000398743 IGKV4-1P06312 121 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 C20orf197Q8N268 126 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 J3KT08 172 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 TENM2Q9NT68 2774 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-202ENST00000398743 H0Y9J4 135 aa8.65□□□□□ -1.02
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PRAME-202ENST00000398743 IGFL1Q6UW32 110 aa8.64□□□□□ -1.03
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PRAME-202ENST00000398743 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.63□□□□□ -1.03
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