RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 GYPAP02724 150 aa-2.5□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 UQCRBP14927 111 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 S100A4P26447 101 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCDC70Q6NSX1 233 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 NACA2Q9H009 215 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-2.5□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 BIRC5O15392 142 aa-2.51□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 BCAP29Q9UHQ4 241 aa-2.51□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 UBL5Q9BZL1 73 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 DKKL1Q9UK85 242 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP-2.52□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 C1orf196B1AJZ1 125 aa-2.53□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 UQCRHP07919 91 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 OCM2P0CE71 109 aa-2.53□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 HIST1H2BOP23527 126 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 SFNP31947 248 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-540P-201ENST00000384622 HIST1H2BBP33778 126 aa-2.53□□□□□ -2.81
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RNU6-540P-201ENST00000384622 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM203Q969S6 136 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 MS4A6EQ96DS6 147 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SCGB3A2Q96PL1 93 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 CPS1P31327 1500 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PRE2 83 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 ATP5LO75964 103 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 SNAPC5O75971 98 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 GUCA1CO95843 209 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 LINC00032P0C843 101 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 TEX37Q96LM6 180 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 NPCDR1Q9BY65 106 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-540P-201ENST00000384622 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-2.55□□□□□ -2.82
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