RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-5.59□□□□□ -3.3
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-5.59□□□□□ -3.3
RNU6-1008P-201ENST00000384160 XIRP2A4UGR9 3374 aa-5.59□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCL2P13500 99 aa-5.6□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GNG5P63218 68 aa-5.6□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MIC13Q5XKP0 118 aa-5.6□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SCAPERQ9BY12 1400 aa-5.6□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 E7EQ34 232 aa-5.61□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-5.61□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RGS21Q2M5E4 152 aa-5.61□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-5.61□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-5.62□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-5.62□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-5.62□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FABP12A6NFH5 140 aa-5.63□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSTD3H0UI37 97 aa-5.63□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPLO60437 1756 aa-5.64□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 THEM6Q8WUY1 208 aa-5.64□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R14BQ96C90 147 aa-5.64□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VAMP8Q9BV40 100 aa-5.64□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYH4Q9Y623 1939 aa-5.65□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SERPINB1P30740 379 aa-5.65□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CALML5Q9NZT1 146 aa-5.65□□□□□ -3.31
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PREX2Q70Z35 1606 aa-5.66□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COX6CP09669 75 aa-5.66□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAPPC2P0DI81 140 aa-5.66□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-5.66□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CFAP53Q96M91 514 aa-5.66□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIF27Q86VH2 1401 aa-5.66□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITSN1Q15811 1721 aa-5.67□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-5.67□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C7orf77A4D0Y5 90 aa-5.67□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-5.67□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGLC2P0DOY2 106 aa-5.68□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGLC3P0DOY3 106 aa-5.68□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC58Q4VC31 144 aa-5.68□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MNS1Q8NEH6 495 aa-5.68□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BANF2Q9H503 90 aa-5.68□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMIM23A6NLE4 172 aa-5.69□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-5.69□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LIN52Q52LA3 116 aa-5.69□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C12orf57Q99622 126 aa-5.69□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-5.69□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPEF2Q9C093 1822 aa-5.69□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCTE3Q8IZS6 198 aa-5.7□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTH2Q96A98 100 aa-5.7□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MED31Q9Y3C7 131 aa-5.7□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLASP1Q7Z460 1538 aa-5.7□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSD52Q0P140 79 aa-5.71□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-5.71□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-5.72□□□□□ -3.32
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIF14Q15058 1648 aa-5.72□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C12orf73Q69YU5 71 aa-5.72□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM218A2RU14 115 aa-5.73□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 M0QX08 132 aa-5.73□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CETN3O15182 167 aa-5.73□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GUCA1BQ9UMX6 200 aa-5.74□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-5.74□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-5.74□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAEPP09466 180 aa-5.75□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NCS1P62166 190 aa-5.75□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GAFA1Q96PS6 74 aa-5.75□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TJP1Q07157 1748 aa-5.75□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-5.75□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TOP2BQ02880 1626 aa-5.76□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DBIP07108 87 aaKnown RBP-5.76□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSPAN19P0C672 248 aa-5.76□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 REEP5Q00765 189 aa-5.76□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-5.76□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-5.77□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DEXIO95424 95 aa-5.77□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PMS2P3Q13401 168 aa-5.77□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q56UQ5 140 aa-5.77□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DYDC1Q8WWB3 177 aa-5.77□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-5.77□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC115Q96NT0 180 aa-5.77□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 F6UZH7 168 aa-5.78□□□□□ -3.33
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHD1O14646 1710 aa-5.79□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UTRNP46939 3433 aa-5.79□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ACBD7Q8N6N7 88 aa-5.79□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C9orf16Q9BUW7 83 aa-5.79□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRO1854Q9UHT4 67 aa-5.79□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-5.8□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATG12O94817 140 aa-5.8□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM24BQ8N5W8 94 aa-5.8□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC32Q9BV29 185 aa-5.8□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BOLA2Q9H3K6 86 aa-5.8□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-5.81□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SFTA3P0C7M3 94 aa-5.81□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-5.81□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C1orf54Q8WWF1 131 aa-5.81□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-5.81□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LTN1O94822 1766 aa-5.82□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CSTAP01040 98 aa-5.82□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPANXDQ9BXN6 97 aa-5.82□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MANBALQ9NQG1 85 aa-5.82□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM244Q5VVB8 128 aa-5.83□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALKAL2Q6UX46 152 aa-5.83□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C6orf48Q9UBA6 75 aa-5.83□□□□□ -3.34
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RGPD1P0DJD0 1748 aa-5.84□□□□□ -3.34
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