RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376042.5

CCNB3-204, Transcript of cyclin B3, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCNB3, Length 4,693 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB3-204	ENST00000376042	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042		J3KT08	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	WFDC2	Q14508	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	LRBA	P50851	2863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042		A0A1W2PNN7	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	MOBP	Q13875	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	FBN2	P35556	2912 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042		A0A1B0GW54	56 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CCNB3-204	ENST00000376042	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	LITAF	Q99732	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	MP68	P56378	58 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042		A0A087WSZ3	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042		Q5VSD8	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	PRR4	Q16378	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNB3-204	ENST00000376042	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	SPINK1	P00995	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	CD164	Q04900	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	OXT	P01178	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	ATOX1	O00244	68 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	SPRR1A	P35321	89 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042		Q8N1X5	172 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	SPEG	Q15772	3267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	LINC00313	P59037	77 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042		Q8N377	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	NF1	P21359	2839 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	DMD	P11532	3685 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042		Q6ZVQ6	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNB3-204	ENST00000376042	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042		Q6ZQT0	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	SPRR1B	P22528	89 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	CXCL6	P80162	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042		Q96NJ1	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	RELN	P78509	3460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCNB3-204	ENST00000376042	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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