RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358355.5

USP20-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,371 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-202ENST00000358355 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.78□□□□□ -1
USP20-202ENST00000358355 KRTAP10-3P60369 221 aa8.77□□□□□ -1
USP20-202ENST00000358355 COX7CP15954 63 aa8.75□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 Q6Q795 121 aa8.75□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 KRTAP10-11P60412 298 aa8.75□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.74□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.74□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 SNURFQ9Y675 71 aa8.74□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 NF1P21359 2839 aa8.74□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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USP20-202ENST00000358355 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.73□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.72□□□□□ -1.01
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USP20-202ENST00000358355 C16orf90A8MZG2 172 aa8.72□□□□□ -1.01
USP20-202ENST00000358355 Q6ZVQ6 151 aa8.72□□□□□ -1.01
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USP20-202ENST00000358355 LINC00846Q9NV44 126 aa8.7□□□□□ -1.02
USP20-202ENST00000358355 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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USP20-202ENST00000358355 Q6ZRP5 223 aa8.67□□□□□ -1.02
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USP20-202ENST00000358355 PRR34Q9NV39 138 aa8.66□□□□□ -1.02
USP20-202ENST00000358355 FAM229AH3BQW9 127 aa8.65□□□□□ -1.02
USP20-202ENST00000358355 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.65□□□□□ -1.02
USP20-202ENST00000358355 V9GYY9 64 aa8.65□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 CHTF8P0CG12 524 aa8.64□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.64□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 PRR15LQ9BU68 103 aa8.64□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 A0A1B0GW54 56 aa8.63□□□□□ -1.03
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USP20-202ENST00000358355 VPREB1P12018 145 aa8.63□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.63□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.62□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 EPM2AB3EWF7 344 aa8.62□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 PDZD2O15018 2839 aa8.62□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.62□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 CXCL6P80162 114 aa8.62□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 HCG22E2RYF7 251 aa8.61□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 CCDC179H3BU77 68 aa8.61□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 LITAFQ99732 161 aa8.61□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.6□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 ZFHX3Q15911 3703 aa8.6□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.6□□□□□ -1.03
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USP20-202ENST00000358355 BRK1Q8WUW1 75 aa8.6□□□□□ -1.03
USP20-202ENST00000358355 Q8NBF4 154 aa8.59□□□□□ -1.03
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USP20-202ENST00000358355 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.58□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 IGLV6-57P01721 117 aa8.57□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.57□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 H0Y9P7 68 aa8.57□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 PCOTHQ58A44 107 aa8.55□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.55□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.55□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.55□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.55□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 PRO0461Q9UI25 63 aa8.55□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 C15orf56Q8N910 161 aa8.54□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 BSNQ9UPA5 3926 aa8.54□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.54□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 FAM168BA1KXE4 195 aa8.53□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.53□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.53□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 Q6ZQT0 140 aa8.53□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 CDIP1Q9H305 208 aa8.53□□□□□ -1.04
USP20-202ENST00000358355 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.52□□□□□ -1.04
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USP20-202ENST00000358355 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.52□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 A0A087WTM6 91 aa8.52□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.5□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 A6NED7 52 aa8.5□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 hDV103S1A0JD37 113 aa8.5□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.5□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.49□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 IGKV2-30P06310 120 aa8.49□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.49□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 APLNQ9ULZ1 77 aa8.49□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.48□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 WIPF1O43516 503 aa8.48□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP20-202ENST00000358355 SMIM29Q86T20 159 aa8.47□□□□□ -1.05
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