RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 EPM2AB3EWF7 344 aa4.11□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 HCG22E2RYF7 251 aa4.11□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 CXCL6P80162 114 aa4.11□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 COX6A2Q02221 97 aa4.11□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.11□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.11□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 LEPROTO15243 131 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 Q6JHZ5 121 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 DIRC1Q969H9 104 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-30P01768 117 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 ENHOQ6UWT2 76 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.1□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 NUPR2A6NF83 97 aa4.09□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.09□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 APLNQ9ULZ1 77 aa4.09□□□□□ -1.75
CCR6-201ENST00000341935 REG3GQ6UW15 175 aa4.09□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.09□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 SCXQ7RTU7 201 aa4.09□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 CCL18P55774 89 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 A0A0J9YXY3 114 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 KLK12Q9UKR0 248 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 PRAC1Q96KF2 57 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 Q9HAA7 133 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 PRR34Q9NV39 138 aa4.08□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.07□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.07□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 SYCNQ0VAF6 134 aa4.07□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.07□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 CRPP02741 224 aa4.07□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.07□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 A8MU10 97 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.06□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 HAMPP81172 84 aa4.05□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 KLKP1Q107X0 134 aa4.05□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 MIAQ16674 131 aa4.05□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.05□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 PRR15LQ9BU68 103 aa4.05□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 UBL5Q9BZL1 73 aa4.05□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.04□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 COX7B2Q8TF08 81 aa4.04□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 LINC00846Q9NV44 126 aa4.04□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.04□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 FBN3Q75N90 2809 aa4.04□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.04□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 C16orf90A8MZG2 172 aa4.03□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 NDUFA1O15239 70 aa4.03□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.03□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 MUC7Q8TAX7 377 aa4.03□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 PRR4Q16378 134 aa4.03□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.03□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.03□□□□□ -1.76
CCR6-201ENST00000341935 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.02□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 Q8IZM0 81 aa4.02□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 MYCBP2O75592 4640 aa4.02□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZRP5 223 aa4.01□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.01□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.01□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 Q1T7F1 81 aa4.01□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0087Q14695 138 aa4.01□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.01□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 LITAFQ99732 161 aa4□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 HIGD2BQ4VC39 106 aa4□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 SPAG11BQ08648 103 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 Q75L30 129 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 C15orf56Q8N910 161 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 CASC10Q5T4H9 136 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 CASC2Q6XLA1 102 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 LINC01600Q96MT4 127 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 A6NN06 94 aa3.99□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 C3orf84H3BNL1 204 aa3.98□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CCR6-201ENST00000341935 NREPQ16612 68 aa3.97□□□□□ -1.77
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