RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GINS3-202ENST00000328514 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.46□□□□□ -1.21
GINS3-202ENST00000328514 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 DAD1P61803 113 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 ESRGQ1W209 222 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 KLK12Q9UKR0 248 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 F8WDY8 70 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 Q8N9L7 120 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 Q8NAQ8 132 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 BRK1Q8WUW1 75 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 APOC4P55056 127 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 DEFB135Q30KP9 77 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-202ENST00000328514 DEFB4AO15263 64 aa7.4□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.4□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.4□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 hDV103S1A0JD37 113 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZRU5 148 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 Q8N377 158 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 ANK2Q01484 3957 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 C3orf84H3BNL1 204 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 C15orf56Q8N910 161 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP10-3P60369 221 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 TNP2Q05952 138 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 Q1T7F1 81 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 INAFM1C9JVW0 142 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 C1orf195Q5TG92 126 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 SMIM29Q86T20 159 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZRP5 223 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 A0A1W2PNM2 257 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 H3BNG1 76 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 SPRR4Q96PI1 79 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-202ENST00000328514 Q8NBF4 154 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 HIVEP2P31629 2446 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 HTN3P15516 51 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 PRR15Q8IV56 129 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZRX8 168 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 VWFP04275 2813 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 DSCR10P59022 87 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 C7orf33Q8WU49 177 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 V9GYY9 64 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 SPRR1AP35321 89 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 C1orf137Q5JT78 98 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 TGP01266 2768 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 SYCNQ0VAF6 134 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 Q9BRP9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS3-202ENST00000328514 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 NDUFB1O75438 58 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 NOTCH1P46531 2555 aa7.26□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.26□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 HCG22E2RYF7 251 aa7.25□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 K7EQZ3 153 aa7.25□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.25□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.23□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 SEC61GP60059 68 aa7.23□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 PSCAO43653 123 aa7.22□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.22□□□□□ -1.25
GINS3-202ENST00000328514 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.21□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.21□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 PMAIP1Q13794 54 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 H3BPC8 53 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 MP68P56378 58 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 FAM168BA1KXE4 195 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 PSPHP1O15172 72 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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