RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.87□□□□□ -0.83
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 RETNQ9HD89 108 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 OCR1Q9BZK8 76 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.82□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PNN7 141 aa9.82□□□□□ -0.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV1-51P01701 117 aa9.82□□□□□ -0.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOTCH1P46531 2555 aa9.82□□□□□ -0.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 H3BQ85 93 aa9.81□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0J9YWU9 116 aa9.81□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZRP5 223 aa9.78□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf137Q5JT78 98 aa9.77□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MP68P56378 58 aa9.73□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR15LQ9BU68 103 aa9.72□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N377 158 aa9.71□□□□□ -0.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A096LNI7 61 aa9.71□□□□□ -0.86
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CCNDBP1-201ENST00000300213 A6NED7 52 aa9.68□□□□□ -0.86
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.66□□□□□ -0.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR15Q8IV56 129 aa9.66□□□□□ -0.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM168BA1KXE4 195 aa9.65□□□□□ -0.86
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CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087WSZ3 146 aa9.63□□□□□ -0.87
CCNDBP1-201ENST00000300213 B9D2Q9BPU9 175 aa9.63□□□□□ -0.87
CCNDBP1-201ENST00000300213 DSCR10P59022 87 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q1T7F1 81 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8NBF4 154 aa9.61□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TENM4Q6N022 2769 aa9.59□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.59□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C15orf56Q8N910 161 aa9.56□□□□□ -0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZRX8 168 aa9.55□□□□□ -0.88
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFS5O43920 106 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q5VV11 94 aa9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 CASC2Q6XLA1 102 aa9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8NAQ8 132 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 INAFM1C9JVW0 142 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD164Q04900 197 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.5□□□□□ -0.89
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