RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL2-201ENST00000296031 B5MCH6 92 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL2-201ENST00000296031 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa14.72□□□□□ -0.05
CXCL2-201ENST00000296031 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.72□□□□□ -0.05
CXCL2-201ENST00000296031 SCGB1D1O95968 90 aa14.71□□□□□ -0.05
CXCL2-201ENST00000296031 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.71□□□□□ -0.05
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZVH6 145 aa14.7□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 COPS9Q8WXC6 57 aa14.7□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 SPRR4Q96PI1 79 aa14.7□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.7□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 IFITM1P13164 125 aa14.69□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.69□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZRX8 168 aa14.68□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.67□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.65□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 Q9BRP9 147 aa14.65□□□□□ -0.06
CXCL2-201ENST00000296031 ERC2-IT1O76042 136 aa14.63□□□□□ -0.07
CXCL2-201ENST00000296031 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CXCL2-201ENST00000296031 TSPAN13O95857 204 aa14.62□□□□□ -0.07
CXCL2-201ENST00000296031 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CXCL2-201ENST00000296031 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.61□□□□□ -0.07
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00483Q53H64 154 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00304Q8N9R0 145 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 A6NDN8 102 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 LRP2P98164 4655 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 COX8AP10176 69 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 C6orf99Q4VX62 202 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.5□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 COX7BP24311 80 aa14.5□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 PRR4Q16378 134 aa14.5□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.5□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 DLEU1O43261 78 aa14.48□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.48□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.47□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.47□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.46□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA45Q537H7 98 aa14.46□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 VAMP8Q9BV40 100 aa14.46□□□□□ -0.09
CXCL2-201ENST00000296031 A4D1N5 150 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 CTAG1AP78358 180 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 C14orf144Q96I85 54 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 SPAG11AQ6PDA7 123 aa14.44□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 Q8NBF4 154 aa14.44□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 HIST1H4GQ99525 98 aa14.44□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 MOBPQ13875 183 aa14.43□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1B0GWB2 263 aa14.41□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.41□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.41□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 LPAP08519 4548 aa14.4□□□□□ -0.1
CXCL2-201ENST00000296031 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.39□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.38□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.38□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 SPRR1BP22528 89 aa14.36□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.36□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 C12orf57Q99622 126 aa14.36□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 HIGD1BQ9P298 99 aa14.36□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 PYY3Q5JQD4 70 aa14.35□□□□□ -0.11
CXCL2-201ENST00000296031 SPINK1P00995 79 aa14.32□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 TAL2Q16559 108 aa14.32□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 DEFB105AQ8NG35 78 aa14.32□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 VAMP3Q15836 100 aa14.31□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.31□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.28□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa14.28□□□□□ -0.12
CXCL2-201ENST00000296031 SLC25A20O43772 301 aa14.25□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.24□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 CFC1BP0CG36 223 aa14.24□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 CFC1P0CG37 223 aa14.24□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 Q1RN00 199 aa14.24□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00575Q6W349 94 aa14.23□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa14.21□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 CEND1Q8N111 149 aa14.21□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 RAB37Q96AX2 223 aa14.21□□□□□ -0.13
CXCL2-201ENST00000296031 H7C2G1 150 aa14.2□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0B4J2C4 111 aa14.19□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM29Q86T20 159 aa14.19□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.18□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 hADV29S1A0JD25 119 aa14.17□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 Q8N377 158 aa14.17□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 RNF213Q63HN8 5207 aa14.16□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.15□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 A6NJY4 79 aa14.15□□□□□ -0.14
CXCL2-201ENST00000296031 TPRXLQ17RH7 258 aa14.13□□□□□ -0.15
CXCL2-201ENST00000296031 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.13□□□□□ -0.15
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZQY7 126 aa14.13□□□□□ -0.15
CXCL2-201ENST00000296031 PRO1933Q9H354 126 aa14.13□□□□□ -0.15
CXCL2-201ENST00000296031 FXYD2P54710 66 aa14.12□□□□□ -0.15
CXCL2-201ENST00000296031 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.1□□□□□ -0.15
CXCL2-201ENST00000296031 HSD52Q0P140 79 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms