RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 H0Y9J4 135 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2AP49459 152 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC42-201ENST00000293845 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC42-201ENST00000293845 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC42-201ENST00000293845 PRLHP81277 87 aa8.03□□□□□ -1.12
CCDC42-201ENST00000293845 DIRC1Q969H9 104 aa8.03□□□□□ -1.12
CCDC42-201ENST00000293845 MYCBP2O75592 4640 aa8.03□□□□□ -1.12
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CCDC42-201ENST00000293845 CEND1Q8N111 149 aa8.02□□□□□ -1.13
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CCDC42-201ENST00000293845 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.01□□□□□ -1.13
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CCDC42-201ENST00000293845 PRO1933Q9H354 126 aa8.01□□□□□ -1.13
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CCDC42-201ENST00000293845 CFC1P0CG37 223 aa7.97□□□□□ -1.13
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CCDC42-201ENST00000293845 OXTP01178 125 aa7.97□□□□□ -1.13
CCDC42-201ENST00000293845 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
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CCDC42-201ENST00000293845 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.96□□□□□ -1.14
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CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GWB2 263 aa7.93□□□□□ -1.14
CCDC42-201ENST00000293845 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.92□□□□□ -1.14
CCDC42-201ENST00000293845 ERC2-IT1O76042 136 aa7.91□□□□□ -1.14
CCDC42-201ENST00000293845 CTAG1AP78358 180 aa7.91□□□□□ -1.14
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CCDC42-201ENST00000293845 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.91□□□□□ -1.14
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
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CCDC42-201ENST00000293845 H7C2G1 150 aa7.88□□□□□ -1.15
CCDC42-201ENST00000293845 M0R143 59 aa7.88□□□□□ -1.15
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CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A20O43772 301 aa7.83□□□□□ -1.16
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN13O95857 204 aa7.83□□□□□ -1.16
CCDC42-201ENST00000293845 SPRR1BP22528 89 aa7.83□□□□□ -1.16
CCDC42-201ENST00000293845 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.83□□□□□ -1.16
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CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.82□□□□□ -1.16
CCDC42-201ENST00000293845 hADV29S1A0JD25 119 aa7.81□□□□□ -1.16
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.8□□□□□ -1.16
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CCDC42-201ENST00000293845 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.78□□□□□ -1.16
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GX51 115 aa7.78□□□□□ -1.16
CCDC42-201ENST00000293845 PSMB2P49721 201 aa7.78□□□□□ -1.16
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CCDC42-201ENST00000293845 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZQY7 126 aa7.77□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.77□□□□□ -1.17
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CCDC42-201ENST00000293845 SNCGO76070 127 aa7.75□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 BATFQ16520 125 aa7.75□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.75□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 Q8N377 158 aa7.74□□□□□ -1.17
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CCDC42-201ENST00000293845 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.73□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC2BQ92478 149 aa7.73□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.73□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.72□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 MOBPQ13875 183 aa7.72□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.72□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.72□□□□□ -1.17
CCDC42-201ENST00000293845 Q8NBF4 154 aa7.71□□□□□ -1.17
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