RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.8□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MWP4 228 aa7.8□□□□□ -1.16
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UBASH3B-201ENST00000284273 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.79□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV7-43P04211 117 aa7.78□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 MTORP42345 2549 aa7.78□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.77□□□□□ -1.17
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UBASH3B-201ENST00000284273 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
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UBASH3B-201ENST00000284273 A0A096LNT2 108 aa7.62□□□□□ -1.19
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UBASH3B-201ENST00000284273 H3BPC8 53 aa7.6□□□□□ -1.19
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UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-2P60368 255 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BS24 57 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMA3Q16787 3333 aa7.33□□□□□ -1.24
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UBASH3B-201ENST00000284273 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.32□□□□□ -1.24
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UBASH3B-201ENST00000284273 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.29□□□□□ -1.24
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UBASH3B-201ENST00000284273 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.25□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 SPINK7P58062 85 aa7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 H7BZZ5 65 aa7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 Q1T7F1 81 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0C4DFX4 3053 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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