RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 M0R378 163 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 F8WEM9 126 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 VPREB1P12018 145 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-11P60412 298 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2BP63146 152 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 OXTP01178 125 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 CASC10Q5T4H9 136 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 C15orf56Q8N910 161 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 FAM236CP0DP71 79 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TMOD1-201ENST00000259365 C7orf33Q8WU49 177 aa8.83□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 A0A096LNI7 61 aa8.82□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.82□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.81□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.81□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.81□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 PDE6GP18545 87 aa8.8□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 PRR4Q16378 134 aa8.8□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.8□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.78□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.78□□□□□ -1
TMOD1-201ENST00000259365 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.011e-8■□□□□ 10.2
TMOD1-201ENST00000259365 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.77□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 PSCAO43653 123 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 H7BZZ5 65 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 Q8N377 158 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 ERC2-IT1O76042 136 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf137Q5JT78 98 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 PRLHP81277 87 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 CXCL6P80162 114 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 C5orf47Q569G3 176 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.71□□□□□ -1.01
TMOD1-201ENST00000259365 COL7A1Q02388 2944 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM29Q86T20 159 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 Q9BRP9 147 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 H3BQ85 93 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV4-1P06312 121 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PNM2 257 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZRX8 168 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 CHTF8P0CG12 524 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0U1RQV1 116 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 Q5XG85 94 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 BRK1Q8WUW1 75 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 ANK2Q01484 3957 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087WSZ3 146 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 K7EQZ3 153 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 KLKP1Q107X0 134 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 PRYO14603 147 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 REG3GQ6UW15 175 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 H3BNG1 76 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.59□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2AP49459 152 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 Q8NBF4 154 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 OCR1Q9BZK8 76 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 H0Y9J4 135 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFC1O43677 76 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 EPM2AB3EWF7 344 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD1-201ENST00000259365 DSCR10P59022 87 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 IGFL1Q6UW32 110 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 PSPHP1O15172 72 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00208Q96KT6 92 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms