RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 CHTF8P0CG12 524 aa6.72□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.72□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 VPREB1P12018 145 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 FABP2P12104 132 aa6.69□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 K7EP34 96 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TRIAP1O43715 76 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 VAMP3Q15836 100 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 H7C2G1 150 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 UBE2V1Q13404 147 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 GAGE2EQ4V326 116 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 IGLV6-57P01721 117 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TMEM126AQ9H061 195 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 GAGE10A6NGK3 116 aa6.65□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 NCR3O14931 201 aa6.65□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 Q1RN00 199 aa6.65□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 A0A096LNI7 61 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 TCL1BO95988 128 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PSMB2P49721 201 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 GAGE2BQ13066 116 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PRR4Q16378 134 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 M0R378 163 aa6.63□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.63□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 FAM168BA1KXE4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 COX6CP09669 75 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PRO0461Q9UI25 63 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 H3BMG7 143 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 LST1O00453 97 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 A0A1W2PNN7 141 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 C22orf24Q9Y442 160 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 H0YGX0 51 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 ATXN8Q156A1 80 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 CLEC2BQ92478 149 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 C6orf99Q4VX62 202 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 F8W1H4 67 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 TRACP01848 142 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 LINC00167Q96N53 147 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 SPRR1AP35321 89 aa6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 A0A1B0GX51 115 aa6.55□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 M0QXV9 152 aa6.55□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 PRYO14603 147 aa6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 LINC00575Q6W349 94 aa6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 DIRC1Q969H9 104 aa6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 C9JAW5 83 aa6.53□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.52□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 SLC25A20O43772 301 aa6.52□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 MTURNQ8N3F0 131 aa6.52□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 H3BT86 120 aa6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 COX7BP24311 80 aa6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.5□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 B5MCH6 92 aa6.49□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 hADV29S1A0JD25 119 aa6.48□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 Q6ZRX8 168 aa6.48□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 MUC17Q685J3 4493 aa6.47□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 ETDBQ3ZM63 59 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms