RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635893.1

SCN1A-211, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene SCN1A, Length 168 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-211ENST00000635893 USP32Q8NFA0 1604 aa-2.48□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-2.48□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 VCANP13611 3396 aa-2.48□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 MT-ATP8P03928 68 aa-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 LINC00158P58513 81 aa-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 CCL8P80075 99 aa-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 C10orf128Q5T292 105 aa-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 PSENENQ9NZ42 101 aa-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 NUP188Q5SRE5 1749 aa-2.49□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 USP34Q70CQ2 3546 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 RGPD5Q99666 1765 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 IGLC1P0CG04 106 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 DEFB130BP0DP73 79 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 DEFB130AP0DP74 79 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 SCGB1A1P11684 91 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 FAIMQ9NVQ4 179 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 SYNJ1O43426 1573 aa-2.5□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 KIF20BQ96Q89 1820 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 LCE6AA0A183 80 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 C3orf79P0CE67 100 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 SPART-AS1P0CW21 52 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 TMEM128Q5BJH2 165 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 SAMD13Q5VXD3 122 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 DPH3Q96FX2 82 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 MGST2Q99735 147 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 PCBD2Q9H0N5 130 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 CEP152O94986 1710 aa-2.51□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 MYOM1P52179 1685 aa-2.52□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-2.52□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 M0QZ58 72 aa-2.52□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 M0R129 80 aa-2.52□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 HMGN4O00479 90 aa-2.52□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 DAPK1P53355 1430 aa-2.52□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 WIZO95785 1651 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 SCN7AQ01118 1682 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 IAPPP10997 89 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 G0S2P27469 103 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 S100A7L2Q5SY68 101 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 MMGT1Q8N4V1 131 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 AQP10Q96PS8 301 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 V9GYQ6 96 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 UNC80Q8N2C7 3258 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 ARHGEF10O15013 1369 aa-2.53□□□□□ -2.81
SCN1A-211ENST00000635893 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 A0A1B0GUL6 1792 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 CBLN1P23435 193 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 LEAP2Q969E1 77 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 ROCK1Q13464 1354 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 DEPDC5O75140 1603 aa-2.54□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-2.55□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TNFSF15O95150 251 aa-2.55□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 QSER1Q2KHR3 1735 aa-2.55□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-2.55□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TCHHQ07283 1943 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 UBR3Q6ZT12 1888 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 F8WEM9 126 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 COX7BP24311 80 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 SERP2Q8N6R1 65 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 SEC11CQ9BY50 192 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-2.56□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 ABCC5O15440 1437 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 A0A0G2JND7 137 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TCTE3Q8IZS6 198 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TRGV9Q99603 122 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 HIGD1AQ9Y241 93 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 PIK3C2BO00750 1634 aa-2.57□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 ADGRL2O95490 1459 aa-2.58□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 IFT140Q96RY7 1462 aa-2.58□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-2.58□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 LYNX1G3V0Z9 82 aa-2.58□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 C9orf153Q5TBE3 101 aa-2.58□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TEX14Q8IWB6 1497 aa-2.58□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 PHLPP1O60346 1717 aa-2.59□□□□□ -2.82
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