RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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CLN3-241ENST00000635861 HERVK_113P61574 105 aa11.34□□□□□ -0.59
CLN3-241ENST00000635861 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.34□□□□□ -0.59
CLN3-241ENST00000635861 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.34□□□□□ -0.59
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CLN3-241ENST00000635861 H3BUT2 72 aa11.33□□□□□ -0.6
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CLN3-241ENST00000635861 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.22□□□□□ -0.61
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CLN3-241ENST00000635861 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.14□□□□□ -0.63
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CLN3-241ENST00000635861 C2orf82Q6UX34 121 aa11.13□□□□□ -0.63
CLN3-241ENST00000635861 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.13□□□□□ -0.63
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CLN3-241ENST00000635861 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.1□□□□□ -0.63
CLN3-241ENST00000635861 CKS1BP61024 79 aa11.1□□□□□ -0.63
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CLN3-241ENST00000635861 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.07□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 J3QQQ9 107 aa11.06□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 CXCL5P42830 114 aa11.06□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.06□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.06□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.05□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 K7ERJ3 54 aa11.05□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 ZNF861PO60384 105 aa11.05□□□□□ -0.64
CLN3-241ENST00000635861 COPS9Q8WXC6 57 aa11.05□□□□□ -0.64
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