RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 KLKP1Q107X0 134 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N3U1 123 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N9L7 120 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 A0A096LPF7 62 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 A0A096LNT2 108 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRT-211ENST00000618610 MIFP14174 115 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF702PQ9H963 129 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZVQ6 151 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N814 137 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2L6O14933 153 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 INSP01308 110 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 DSCR9P59020 149 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM89A2RUT3 159 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 STHQ8IWL8 128 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 RETNQ9HD89 108 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf99Q4VX62 202 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 Q6YL49 198 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 NREPQ16612 68 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZQT0 140 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 PSPHP1O15172 72 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 PMAIP1Q13794 54 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 A8MU10 97 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 K7EQD1 137 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 PRR4Q16378 134 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-211ENST00000618610 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 ESRGQ1W209 222 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 Q8NDZ9 215 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 BPY2O14599 106 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZQY7 126 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 CELA1Q9UNI1 258 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 LY6G6DO95868 133 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01006Q8NI28 216 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00167Q96N53 147 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 PRYO14603 147 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 CCL24O00175 119 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 J3QKU1 62 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB130BP0DP73 79 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB130AP0DP74 79 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 HTN3P15516 51 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFC1O43677 76 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 TGP01266 2768 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 INAFM1C9JVW0 142 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00575Q6W349 94 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZTC4 211 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 ANK2Q01484 3957 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf223Q8N319 242 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 MUC7Q8TAX7 377 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZRP5 223 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 FSHBP01225 129 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf25Q5T742 122 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 COL7A1Q02388 2944 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 BCE1O60756 84 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 CXCL6P80162 114 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 C3orf84H3BNL1 204 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRT-211ENST00000618610 PRR15Q8IV56 129 aa5.56□□□□□ -1.52
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