RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608137.5

LINC00635-216, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 660 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-216ENST00000608137 IFITM1P13164 125 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-216ENST00000608137 GCSHP23434 173 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-216ENST00000608137 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-216ENST00000608137 COPS9Q8WXC6 57 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-216ENST00000608137 HSPG2P98160 4391 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-216ENST00000608137 GHRHP01286 108 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 GAGE2EQ4V326 116 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 CEND1Q8N111 149 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 M0R143 59 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 Q6ZRP5 223 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 CDK2AP2O75956 126 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 PTTG1IPP53801 180 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 KRTAP10-2P60368 255 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 GAGE2BQ13066 116 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 LINC01620Q4KN68 170 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 A4D1N5 150 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 FXYD2P54710 66 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 BATFQ16520 125 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 A0A096LNI7 61 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LINC00635-216ENST00000608137 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 A6NDN8 102 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 NCR3O14931 201 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 NDUFC2O95298 119 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 CHTF8P0CG12 524 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 RAB37Q96AX2 223 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 A0A0B4J2C4 111 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 FAM168BA1KXE4 195 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 CFC1BP0CG36 223 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 CFC1P0CG37 223 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 VPREB1P12018 145 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 Q8NDZ9 215 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 K7ERJ3 54 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 Q8N1X5 172 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 DPH3Q96FX2 82 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 A0A1B0GWB2 263 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 IGKV2D-28P01615 120 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LINC00635-216ENST00000608137 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 A0A1W2PNN7 141 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 PANO1I0J062 215 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 M0R378 163 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 KRTAP10-1P60331 282 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 FAM229AH3BQW9 127 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 M0QXV9 152 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 C22orf24Q9Y442 160 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 FAT1Q14517 4588 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 GAGE10A6NGK3 116 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 H7C2G1 150 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 XGP55808 180 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 Q1RN00 199 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 C7orf33Q8WU49 177 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 A0A087WYN8 130 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00635-216ENST00000608137 TMEM126AQ9H061 195 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms