RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
FCHO1-228ENST00000599236 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
FCHO1-228ENST00000599236 IGLC3P0DOY3 106 aa7.83□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.83□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 H3BRM9 83 aa7.82□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 SPINK1P00995 79 aa7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 MT1HP80294 61 aa7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 COX17Q14061 63 aa7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 Q8N377 158 aa7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 A0A096LNJ9 63 aa7.8□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 A0A0U1RRA0 63 aa7.8□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 XP32Q5T750 250 aa7.8□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 NDUFA6P56556 154 aa7.79□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 C11orf86A6NJI1 115 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 ERC2-IT1O76042 136 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 SPRR1AP35321 89 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 LINC00483Q53H64 154 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-228ENST00000599236 LINC00158P58513 81 aa7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 MOBPQ13875 183 aa7.76□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.76□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 FA2HQ7L5A8 372 aa7.76□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.75□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 LINC01549A6NIU2 74 aa7.75□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 NCR3O14931 201 aa7.75□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.75□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 PRYO14603 147 aa7.74□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 PMCHL1Q16048 86 aa7.74□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 SMIM13P0DJ93 91 aa7.73□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.73□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.72□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.72□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.72□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.72□□□□□ -1.17
FCHO1-228ENST00000599236 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.71□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 B5MCH6 92 aa7.71□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.71□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 PCOTHQ58A44 107 aa7.71□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 CLLU1Q5K131 121 aa7.71□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 BAGE3Q86Y29 109 aa7.71□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 SLC25A20O43772 301 aa7.7□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 Q9BRP9 147 aa7.7□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.69□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.69□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.69□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM223A0PJW6 202 aa7.68□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 IFITM2Q01629 132 aa7.68□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.67□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 LINC00614P0C842 121 aa7.67□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 HBDP02042 147 aa7.66□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 SFTA2Q6UW10 78 aa7.66□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 UQCC3Q6UW78 93 aa7.66□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.66□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.66□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM218A2RU14 115 aa7.65□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 SSPOA2VEC9 5147 aa7.65□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 CFC1BP0CG36 223 aa7.65□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
FCHO1-228ENST00000599236 C9orf92A6NGG3 77 aa7.64□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 USH2AO75445 5202 aa7.64□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 ATP6V1G1O75348 118 aa7.63□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.63□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.63□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 S100PP25815 95 aa7.62□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.61□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 DDTP30046 118 aa7.6□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 COX19Q49B96 90 aa7.6□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 Q6ZRX8 168 aa7.6□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 SEC11CQ9BY50 192 aa7.6□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.59□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.59□□□□□ -1.19
FCHO1-228ENST00000599236 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.58□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.58□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.58□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.58□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.57□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 HERV-K104P63124 156 aa7.57□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 IGLV6-57P01721 117 aa7.56□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 NDUFA5Q16718 116 aa7.56□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.56□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.55□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 M0R2T5 61 aa7.55□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 COMMD7Q86VX2 200 aa7.55□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.54□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.53□□□□□ -1.2
FCHO1-228ENST00000599236 S100A12P80511 92 aa7.52□□□□□ -1.21
FCHO1-228ENST00000599236 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.52□□□□□ -1.21
FCHO1-228ENST00000599236 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.51□□□□□ -1.21
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.51□□□□□ -1.21
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
FCHO1-228ENST00000599236 LINC00587B1AMM8 73 aa7.51□□□□□ -1.21
FCHO1-228ENST00000599236 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.51□□□□□ -1.21
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