RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM223	A0PJW6	202 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	IGKC	P01834	107 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	C5orf52	A6NGY3	159 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	LINC01545	Q5VT33	79 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	C22orf24	Q9Y442	160 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ILF3-223	ENST00000593061	C20orf202	A1L168	122 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-223	ENST00000593061	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-223	ENST00000593061	HERVK_113	P61574	105 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ILF3-223	ENST00000593061	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	AKR1D1	P51857	326 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	SFTA2	Q6UW10	78 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	LEPROT	O15243	131 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF861P	O60384	105 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	GAGE10	A6NGK3	116 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00167	Q96N53	147 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061		E9PLD3	99 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061		J3QQQ9	107 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	PFN2	P35080	140 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	LPA	P08519	4548 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	RNF213	Q63HN8	5207 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ILF3-223	ENST00000593061	BCE1	O60756	84 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	NMU	P48645	174 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	HERV-K104	P63124	156 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	ATOH7	Q8N100	152 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	ERG28	Q9UKR5	140 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	COX17	Q14061	63 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	SCGB1D1	O95968	90 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	IGKV2D-28	P01615	120 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00587	B1AMM8	73 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	UBE2A	P49459	152 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00158	P58513	81 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	SMIM13	P0DJ93	91 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	VPREB1	P12018	145 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061		A0A087X002	238 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061		A0A0U1RRA0	63 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF815P	A8K554	130 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ILF3-223	ENST00000593061		A0A0J9YXY3	114 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	CRYGA	P11844	174 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	PRR4	Q16378	134 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061		Q8NDZ9	215 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM238	C9JI98	176 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	TSPAN13	O95857	204 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	PRLH	P81277	87 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM126A	Q9H061	195 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	PCP2	Q8IVA1	136 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061	TIMM17B	O60830	172 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-223	ENST00000593061		M0R378	163 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	DAND5	Q8N907	189 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	PYY3	Q5JQD4	70 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	LITAF	Q99732	161 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	VAMP8	Q9BV40	100 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	SPATA45	Q537H7	98 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ILF3-223	ENST00000593061	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	NCR3	O14931	201 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	COX8A	P10176	69 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	SPANXC	Q9NY87	97 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	NPC2	P61916	151 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		11.24	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms