RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC01549A6NIU2 74 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 IGLC3P0DOY3 106 aa7.33□□□□□ -1.24
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NEDD4L-232ENST00000591579 COX17Q14061 63 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 FA2HQ7L5A8 372 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.32□□□□□ -1.24
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NEDD4L-232ENST00000591579 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC01546A6NGU7 62 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC00158P58513 81 aa7.3□□□□□ -1.24
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NEDD4L-232ENST00000591579 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 PRYO14603 147 aa7.27□□□□□ -1.25
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NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.27□□□□□ -1.25
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NEDD4L-232ENST00000591579 C11orf86A6NJI1 115 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC00483Q53H64 154 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 XP32Q5T750 250 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 Q8N377 158 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC25A20O43772 301 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 LCE2CQ5TA81 110 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 A0A096LNJ9 63 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP6V1G1O75348 118 aa7.23□□□□□ -1.25
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NEDD4L-232ENST00000591579 SPRR1AP35321 89 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 PMCHL1Q16048 86 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 BAGE3Q86Y29 109 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 HBDP02042 147 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 SMIM13P0DJ93 91 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 MT1HP80294 61 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 S100A12P80511 92 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 ERC2-IT1O76042 136 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 B5MCH6 92 aa7.18□□□□□ -1.26
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NEDD4L-232ENST00000591579 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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NEDD4L-232ENST00000591579 SEC11CQ9BY50 192 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 Q9BRP9 147 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM218A2RU14 115 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 DDTP30046 118 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 HERV-K104P63124 156 aa7.14□□□□□ -1.27
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NEDD4L-232ENST00000591579 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC00587B1AMM8 73 aa7.11□□□□□ -1.27
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NEDD4L-232ENST00000591579 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 CLLU1Q5K131 121 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.09□□□□□ -1.27
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NEDD4L-232ENST00000591579 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.09□□□□□ -1.27
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NEDD4L-232ENST00000591579 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.08□□□□□ -1.28
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NEDD4L-232ENST00000591579 LIMD2Q9BT23 127 aa7.08□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.08□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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NEDD4L-232ENST00000591579 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.07□□□□□ -1.28
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NEDD4L-232ENST00000591579 RHEBQ15382 184 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 H0Y8G0 127 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 IGLV6-57P01721 117 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 COMMD7Q86VX2 200 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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