RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EP34 96 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 LY6G6CO95867 125 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2V1Q13404 147 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM126AQ9H061 195 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 LYSTQ99698 3801 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 LECT2O14960 151 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R2N4 97 aa14.81□□□□□ -0.04
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CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZR54 194 aa14.8□□□□□ -0.04
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CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.79□□□□□ -0.04
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CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV2D-28P01615 120 aa14.78□□□□□ -0.04
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CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.77□□□□□ -0.05
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CAPNS1-212ENST00000591041 SNCGO76070 127 aa14.76□□□□□ -0.05
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CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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CAPNS1-212ENST00000591041 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.72□□□□□ -0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 SLPIP03973 132 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE2BQ13066 116 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N814 137 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.69□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 WFDC2Q14508 124 aa14.69□□□□□ -0.06
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CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 F8W1H4 67 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 VPREB1P12018 145 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 C16orf90A8MZG2 172 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WTM6 91 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BMG7 143 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 TCL1BO95988 128 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV6-57P01721 117 aa14.65□□□□□ -0.06
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CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.63□□□□□ -0.07
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CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GX51 115 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAL4O96015 105 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 TRACP01848 142 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 DIRC1Q969H9 104 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01620Q4KN68 170 aa14.59□□□□□ -0.07
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CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.58□□□□□ -0.08
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CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC2BQ92478 149 aa14.57□□□□□ -0.08
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CAPNS1-212ENST00000591041 GHRHP01286 108 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.56□□□□□ -0.08
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CAPNS1-212ENST00000591041 C9JAW5 83 aa14.55□□□□□ -0.08
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CAPNS1-212ENST00000591041 H3BQ85 93 aa14.52□□□□□ -0.09
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CAPNS1-212ENST00000591041 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf33Q8WU49 177 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 C22orf24Q9Y442 160 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.51□□□□□ -0.09
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CAPNS1-212ENST00000591041 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.5□□□□□ -0.09
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CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.48□□□□□ -0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00167Q96N53 147 aa14.46□□□□□ -0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 PRO0461Q9UI25 63 aa14.46□□□□□ -0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.45□□□□□ -0.1
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CAPNS1-212ENST00000591041 hADV29S1A0JD25 119 aa14.44□□□□□ -0.1
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