RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 LITAFQ99732 161 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 ERG28Q9UKR5 140 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM168BA1KXE4 195 aa3.86□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL5P42830 114 aa3.86□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf177Q52M58 125 aa3.86□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.86□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.86□□□□□ -1.79
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CAPNS1-208ENST00000589162 KMT2AQ03164 3969 aa3.86□□□□□ -1.79
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CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.85□□□□□ -1.79
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CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.85□□□□□ -1.79
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CAPNS1-208ENST00000589162 HERV-K104P63124 156 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.84□□□□□ -1.79
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CAPNS1-208ENST00000589162 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH2Q9P225 4427 aa3.83□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PNN7 141 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf90A8MZG2 172 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 GCSHP23434 173 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 PTTG1IPP53801 180 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 GAGE10A6NGK3 116 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 F8WDY8 70 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 NCR3O14931 201 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 DLEU1O43261 78 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 CTAG1AP78358 180 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF151Q2KHN1 245 aa3.82□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H4GQ99525 98 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SPANXCQ9NY87 97 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WYN8 130 aa3.8□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 TSTD3H0UI37 97 aa3.8□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 FXYD2P54710 66 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 HIGD1BQ9P298 99 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.8□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 A4D1N5 150 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 K7ERJ3 54 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2D-28P01615 120 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 SFTA2Q6UW10 78 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SCXQ7RTU7 201 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 M0QXV9 152 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 XGP55808 180 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 CEND1Q8N111 149 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 C7orf33Q8WU49 177 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-208ENST00000589162 C22orf24Q9Y442 160 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-208ENST00000589162 H7C2G1 150 aa3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZSA8 131 aa3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.77□□□□□ -1.81
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