RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568839.5

E2F4-212, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 944 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-212ENST00000568839 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.58□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 M0R378 163 aa6.58□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 TPRXLQ17RH7 258 aa6.58□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.58□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.58□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 MUC2Q02817 5179 aa6.57□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 A0A096LNJ9 63 aa6.57□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 C11orf86A6NJI1 115 aa6.57□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 S100A12P80511 92 aa6.57□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 COMMD7Q86VX2 200 aa6.57□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 LINC00587B1AMM8 73 aa6.56□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 PMCHL1Q16048 86 aa6.56□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.56□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 A0A0U1RRA0 63 aa6.55□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 IFITM2Q01629 132 aa6.54□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.54□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.54□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.54□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 PRYO14603 147 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 HERV-K104P63124 156 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 NDUFA5Q16718 116 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 SPRR4Q96PI1 79 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.53□□□□□ -1.36
E2F4-212ENST00000568839 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.52□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 TMEM223A0PJW6 202 aa6.52□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 SNAPINO95295 136 aa6.52□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.52□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.51□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 SMIM13P0DJ93 91 aa6.51□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 Q8NDZ9 215 aa6.51□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 APOC3P02656 99 aa6.5□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 SVBPQ8N300 66 aa6.5□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.5□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.49□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 SPINK1P00995 79 aa6.49□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.49□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.49□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.49□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 NCR3O14931 201 aa6.48□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 HSBP1O75506 76 aa6.48□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 Q8NBF4 154 aa6.48□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 DAND5Q8N907 189 aa6.47□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.47□□□□□ -1.37
E2F4-212ENST00000568839 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.46□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 SPRR1AP35321 89 aa6.46□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.46□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.46□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 H0Y8G0 127 aa6.45□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.45□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 LINC00483Q53H64 154 aa6.44□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.44□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 LEPROTL1O95214 131 aa6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 PLNP26678 52 aa6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 DDTP30046 118 aa6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 HERVK_113P61574 105 aa6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.43□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 B5MCH6 92 aa6.42□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 LEPROTO15243 131 aa6.42□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 SLC25A20O43772 301 aa6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 NMUP48645 174 aa6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 MOBPQ13875 183 aa6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.41□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 J3QQQ9 107 aa6.4□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.4□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 Q6ZRX8 168 aa6.4□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.4□□□□□ -1.38
E2F4-212ENST00000568839 DPM2O94777 84 aa6.39□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 NDUFC2O95298 119 aa6.39□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 S100A1P23297 94 aa6.39□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.38□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 YPEL4Q96NS1 127 aa6.38□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.37□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 ERC2-IT1O76042 136 aa6.37□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 IGKCP01834 107 aa6.37□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 Q8N377 158 aa6.37□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 Q9BRP9 147 aa6.37□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 MUC17Q685J3 4493 aa6.36□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 C5orf52A6NGY3 159 aa6.36□□□□□ -1.39
E2F4-212ENST00000568839 SERF1AO75920 110 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.1 ms