RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 SPRR1AP35321 89 aa6.26□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.26□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 RAB14P61106 215 aa6.24□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 SFTA2Q6UW10 78 aa6.24□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.24□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 SPINK1P00995 79 aa6.23□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00483Q53H64 154 aa6.23□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 LCE2CQ5TA81 110 aa6.23□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 Q8NBF4 154 aa6.23□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 FA2HQ7L5A8 372 aa6.22□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.22□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 DAND5Q8N907 189 aa6.22□□□□□ -1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 C11orf86A6NJI1 115 aa6.21□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 PRYO14603 147 aa6.21□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.21□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 COX19Q49B96 90 aa6.21□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.21□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.2□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 CLLU1Q5K131 121 aa6.2□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 XP32Q5T750 250 aa6.2□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 Q8N377 158 aa6.2□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.2□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.2□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM218A2RU14 115 aa6.19□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 HBDP02042 147 aa6.18□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 UQCC3Q6UW78 93 aa6.18□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.18□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00614P0C842 121 aa6.17□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 S100PP25815 95 aa6.17□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 NDUFA6P56556 154 aa6.17□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00158P58513 81 aa6.17□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.17□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.17□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM223A0PJW6 202 aa6.16□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.16□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 BAGE3Q86Y29 109 aa6.16□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.16□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 SEC11CQ9BY50 192 aa6.16□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 A0A0U1RRA0 63 aa6.15□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 PMCHL1Q16048 86 aa6.15□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.15□□□□□ -1.42
KIAA0556-208ENST00000568622 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 B5MCH6 92 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC25A20O43772 301 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 ERC2-IT1O76042 136 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 SMIM13P0DJ93 91 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 MOBPQ13875 183 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.14□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 NCR3O14931 201 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 Q9BRP9 147 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 HERV-K104P63124 156 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 MT1HP80294 61 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.1□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.1□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 RHEBQ15382 184 aa6.1□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 Q6ZRX8 168 aa6.1□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00587B1AMM8 73 aa6.09□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 IFITM2Q01629 132 aa6.09□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.09□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.09□□□□□ -1.43
KIAA0556-208ENST00000568622 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.08□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.07□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 LCE2BO14633 110 aa6.07□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP6V1G1O75348 118 aa6.07□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 IGLV6-57P01721 117 aa6.07□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 DDTP30046 118 aa6.07□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.07□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.06□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 CFC1BP0CG36 223 aa6.06□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.06□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 S100A12P80511 92 aa6.06□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.06□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 NDUFC2O95298 119 aa6.05□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 C5orf52A6NGY3 159 aa6.04□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 SPRR1BP22528 89 aa6.03□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 PCOTHQ58A44 107 aa6.03□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 YPEL4Q96NS1 127 aa6.03□□□□□ -1.44
KIAA0556-208ENST00000568622 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.02□□□□□ -1.45
KIAA0556-208ENST00000568622 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
KIAA0556-208ENST00000568622 COMMD7Q86VX2 200 aa6.02□□□□□ -1.45
KIAA0556-208ENST00000568622 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.02□□□□□ -1.45
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms