RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ENHO	Q6UWT2	76 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00575	Q6W349	94 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559		Q8NDZ9	215 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ATOX1	O00244	68 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	UQCRQ	O14949	82 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559		H3BNG1	76 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV6-57	P01721	117 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	hADV29S1	A0JD25	119 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559		H3BQ85	93 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	HIVEP1	P15822	2718 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		12.39	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		12.38	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	COX7C	P15954	63 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	UBL5	Q9BZL1	73 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	GHRH	P01286	108 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	DIRC1	Q969H9	104 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf48	Q96LS8	159 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	PDE6G	P18545	87 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		12.3	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZQT0	140 aa		12.29	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZQY7	126 aa		12.29	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	CRYGA	P11844	174 aa		12.28	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		12.28	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WVE0	104 aa		12.28	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L23	D6RBM5	183 aa		12.28	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	DSCR8	Q96T75	97 aa		12.28	□□□□□ -0.44
RRN3-205	ENST00000563559	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		12.27	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZTC4	211 aa		12.27	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SERP2	Q8N6R1	65 aa		12.27	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559		F8WDY8	70 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	COX7B	P24311	80 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf56	Q8N813	242 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	RETN	Q9HD89	108 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559		M0R378	163 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VPREB1	P12018	145 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-11	P60412	298 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		12.24	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZRU5	148 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf56	Q8N910	161 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ESRG	Q1W209	222 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		12.22	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		12.22	□□□□□ -0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.18	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559	UPK3B	Q9BT76	320 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559	SYCN	Q0VAF6	134 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZVQ6	151 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZRP5	223 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	BCE1	O60756	84 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL6	P80162	114 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559		M0R2N4	97 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	HAMP	P81172	84 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM258	P61165	79 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SVIP	Q8NHG7	77 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	F8	P00451	2351 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RRN3-205	ENST00000563559	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ANK2	Q01484	3957 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	STAB1	Q9NY15	2570 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559		J3KT08	172 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		12.02	□□□□□ -0.48

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