RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.97□□□□□ -1.45
INO80E-204ENST00000562291 CST9LQ9H4G1 147 aa5.97□□□□□ -1.45
INO80E-204ENST00000562291 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.97□□□□□ -1.45
INO80E-204ENST00000562291 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.97□□□□□ -1.45
INO80E-204ENST00000562291 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.97□□□□□ -1.45
INO80E-204ENST00000562291 FAM168BA1KXE4 195 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 C9orf118A6NHY6 69 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 CKS1BP61024 79 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 TAL2Q16559 108 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 TOMM6Q96B49 74 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 GAGE10A6NGK3 116 aa5.95□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 KRTAP10-8P60410 259 aa5.95□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 HERVK_113P63121 156 aa5.95□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 ERASQ7Z444 233 aa5.95□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.95□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 TIMM17AQ99595 171 aa5.95□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.94□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 K7EP34 96 aa5.94□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.94□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.94□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 J3QR89 54 aa5.93□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 UBE2BP63146 152 aa5.93□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 Q8IZM0 81 aa5.93□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 VPS25Q9BRG1 176 aa5.93□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 IGLV7-43P04211 117 aa5.92□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 SCGB1A1P11684 91 aa5.92□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 A0A096LNJ9 63 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 M0QXV9 152 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 SMIM13P0DJ93 91 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 FABP2P12104 132 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 ODF1Q14990 250 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 DIRC1Q969H9 104 aa5.91□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 A0A1W2PPM0 123 aa5.9□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 DPM2O94777 84 aa5.9□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 PLNP26678 52 aa5.9□□□□□ -1.46
INO80E-204ENST00000562291 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 F8VRH5 84 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 F8W1H4 67 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 IGKCP01834 107 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 PMVKQ15126 192 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 COX7B2Q8TF08 81 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 C22orf24Q9Y442 160 aa5.89□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 CXCL5P42830 114 aa5.88□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.88□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.87□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 H0Y9J4 135 aa5.87□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 SPINK8P0C7L1 97 aa5.87□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.87□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 A6NJY4 79 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 H0Y8G0 127 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 H3BUT2 72 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 CEND1Q8N111 149 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 NMUP48645 174 aa5.85□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 Q6ZVH6 145 aa5.85□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 TNXBP22105 4242 aa5.84□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 A0A1B0GWB2 263 aa5.84□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 E9PLD3 99 aa5.84□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 ZNF861PO60384 105 aa5.84□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 MTURNQ8N3F0 131 aa5.84□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.84□□□□□ -1.47
INO80E-204ENST00000562291 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.83□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.83□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 LINC00167Q96N53 147 aa5.83□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.82□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 PFN2P35080 140 aa5.82□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.82□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.81□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 HERVK_113P61574 105 aa5.81□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.81□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 PCP2Q8IVA1 136 aa5.81□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.81□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.8□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.8□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 BCE1O60756 84 aa5.8□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 SIGMAR1Q99720 223 aa5.8□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.79□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.79□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 TMEM238C9JI98 176 aa5.79□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 FXYD2P54710 66 aa5.79□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
INO80E-204ENST00000562291 A0A1B0GV72 72 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms