RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 LITAFQ99732 161 aa5.28□□□□□ -1.56
TMOD3-211ENST00000561438 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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TMOD3-211ENST00000561438 NDUFA1O15239 70 aa5.27□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.27□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.27□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.27□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 FAM168BA1KXE4 195 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 C20orf202A1L168 122 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 APOMO95445 188 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 NMUP48645 174 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 Q6ZSA8 131 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 DAND5Q8N907 189 aa5.26□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 C14orf177Q52M58 125 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 SPATA45Q537H7 98 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 C14orf144Q96I85 54 aa5.24□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 ERG28Q9UKR5 140 aa5.24□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.23□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 A0A1W2PNN7 141 aa5.23□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 PFN2P35080 140 aa5.23□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 VAMP8Q9BV40 100 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.22□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 HERVK_113P61574 105 aa5.22□□□□□ -1.57
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TMOD3-211ENST00000561438 GAGE2EQ4V326 116 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-211ENST00000561438 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.21□□□□□ -1.58
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TMOD3-211ENST00000561438 C12orf57Q99622 126 aa5.2□□□□□ -1.58
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TMOD3-211ENST00000561438 LINC00158P58513 81 aa5.18□□□□□ -1.58
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TMOD3-211ENST00000561438 HERV-K104P63124 156 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.17□□□□□ -1.58
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TMOD3-211ENST00000561438 MYCBP2O75592 4640 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.16□□□□□ -1.58
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TMOD3-211ENST00000561438 TIMM17BO60830 172 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV2D-28P01615 120 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 COX17Q14061 63 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-211ENST00000561438 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.16□□□□□ -1.58
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TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 SFTA2Q6UW10 78 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 C7orf33Q8WU49 177 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-211ENST00000561438 HIGD1BQ9P298 99 aa5.14□□□□□ -1.59
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