RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TIMM17BO60830 172 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 USP17L23D6RBM5 183 aa5.9□□□□□ -1.46
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SMAD3-215ENST00000560424 SMIM13P0DJ93 91 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 CXCL5P42830 114 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 VAMP3Q15836 100 aa5.9□□□□□ -1.46
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SMAD3-215ENST00000560424 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
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SMAD3-215ENST00000560424 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
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SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WYN8 130 aa5.86□□□□□ -1.47
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SMAD3-215ENST00000560424 PRSS2P07478 247 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 IFITM1P13164 125 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE10A6NGK3 116 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 COX17Q14061 63 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 CFAP161Q6P656 301 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf48Q96LS8 159 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 LPAP08519 4548 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GWB2 263 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP10-8P60410 259 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 SPAG11BQ08648 103 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-215ENST00000560424 C15orf56Q8N910 161 aa5.84□□□□□ -1.47
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SMAD3-215ENST00000560424 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
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SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPM0 123 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 H3BUT2 72 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 K7EP34 96 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 CHTF8P0CG12 524 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 FXYD2P54710 66 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 ERG28Q9UKR5 140 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 RNF151Q2KHN1 245 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf82Q6UX34 121 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.8□□□□□ -1.48
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SMAD3-215ENST00000560424 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 MUC2Q02817 5179 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0B4J2C4 111 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.79□□□□□ -1.48
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SMAD3-215ENST00000560424 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 A4D1N5 150 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00158P58513 81 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf25Q5T742 122 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-215ENST00000560424 K7ERU9 68 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFC2O95298 119 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 CFC1BP0CG36 223 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 CFC1P0CG37 223 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 SYCNQ0VAF6 134 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.77□□□□□ -1.49
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