RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1B0GUT8 65 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 HBBP68871 147 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 MT1HP80294 61 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1B0GWB2 263 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00862A6NCI5 91 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIGD1CA8MV81 97 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 A8MWL6 223 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 COMMD7Q86VX2 200 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF727A8MUV8 499 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R2P9O14990 202 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R17O96001 155 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8N9L7 120 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 C20orf78Q9BR46 151 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 C9JQL5 133 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM250H0YL14 139 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFA5Q16718 116 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 BORCS7Q96B45 105 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCAPO15273 167 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8IZM0 81 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC01551Q86U37 167 aa4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 F8VRH5 84 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNAPINO95295 136 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRLHP81277 87 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 V9GYV3 84 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2AP49459 152 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEBPGP53567 150 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM141Q96I45 108 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 OSTCQ9NRP0 149 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM218A2RU14 115 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPYP01303 97 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 CKS1BP61024 79 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 PEA15Q15121 130 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6ZN92 141 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMELXQ99217 191 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 D6R8Y8 96 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADCYAP1P18509 176 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 CXCL5P42830 114 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 UQCC3Q6UW78 93 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTURNQ8N3F0 131 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1B0GXF2 115 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 F8W036 122 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCO1O75880 301 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2D-28P01615 120 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP5-9P26371 169 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 CKS2P33552 79 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM126AQ9H061 195 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM238C9JI98 176 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R378 163 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 APOC3P02656 99 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A1P23297 94 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPRR4Q96PI1 79 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1B0GW15 77 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGIPA6NJ69 53 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPINK1P00995 79 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPBPP02775 128 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 HERVK_113P63121 156 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8NDZ9 215 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEC11CQ9BY50 192 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.52□□□□□ -1.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 DAND5Q8N907 189 aa4.52□□□□□ -1.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.52□□□□□ -1.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.52□□□□□ -1.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADIRFQ15847 76 aa4.51□□□□□ -1.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.51□□□□□ -1.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 ORMDL3Q8N138 153 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms