RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.18□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.18□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 CKS2P33552 79 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 SEC11AP67812 179 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM17AQ99595 171 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 PPBPP02775 128 aa5.16□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 NPSP0C0P6 89 aa5.16□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 HERVK_113P63121 156 aa5.16□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.16□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.16□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 D6R8Y8 96 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV6-57P01721 117 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 VCX2Q9H322 139 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 COX7B2Q8TF08 81 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 LIMD2Q9BT23 127 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 ATP5LO75964 103 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 NPYP01303 97 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 TRGC2P03986 189 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 VPREB1P12018 145 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS47A8MTI9 375 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 PFN2P35080 140 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 PRELID3AQ96N28 172 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00483Q53H64 154 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 ORMDL3Q8N138 153 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 K7EMI3 77 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BKO60814 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 S100A6P06703 90 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BJP06899 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BOP23527 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BBP33778 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BDP58876 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BCP62807 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 LINC01549A6NIU2 74 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 LCE2BO14633 110 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 G0S2P27469 103 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 AMELXQ99217 191 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 PRYO14603 147 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 S100A12P80511 92 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 BAGE3Q86Y29 109 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 LINC01546A6NGU7 62 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 C5orf52A6NGY3 159 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00614P0C842 121 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 Q8N8P6 123 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA6P56556 154 aa5.05□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf202A1L168 122 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK8P0C7L1 97 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 COX17Q14061 63 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 FA2HQ7L5A8 372 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 ERG28Q9UKR5 140 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 HSBP1O75506 76 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 MT2AP02795 61 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 S100A2P29034 98 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-10P60014 251 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 SERF1AO75920 110 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 H3BRM9 83 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 AKR1D1P51857 326 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 464.6 ms