RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 DAND5Q8N907 189 aa3.61□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.61□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 K7EP13 123 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 M0R2N4 97 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 LECT2O14960 151 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMIM13P0DJ93 91 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 PFN2P35080 140 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 FXYD2P54710 66 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 HERV-K104P63124 156 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 CASC10Q5T4H9 136 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 RMI2Q96E14 147 aa3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 K7ERJ3 54 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSCAO43653 123 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 LY6G6CO95867 125 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC00158P58513 81 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA0087Q14695 138 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAL2Q16559 108 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 C15orf56Q8N910 161 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB37Q96AX2 223 aa3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.59□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 LYSTQ99698 3801 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 A6NDN8 102 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP17L23D6RBM5 183 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TIMM17BO60830 172 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 CXCL5P42830 114 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTC32Q5I0X7 151 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q6ZVH6 145 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPANXCQ9NY87 97 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERG28Q9UKR5 140 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 A4D1N5 150 aa3.57□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 SFTA2Q6UW10 78 aa3.57□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q6ZRU5 148 aa3.57□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.57□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1B0GV90 55 aa3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 C3orf84H3BNL1 204 aa3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAX1BP3O14907 124 aa3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 WFDC2Q14508 124 aa3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.56□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 H7C2G1 150 aa3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFITM1P13164 125 aa3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYCNQ0VAF6 134 aa3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 COPS9Q8WXC6 57 aa3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2orf48Q96LS8 159 aa3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 CARD19Q96LW7 228 aa3.55□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 H3BUT2 72 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 DSCR10P59022 87 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q1RN00 199 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 GAGE2EQ4V326 116 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.54□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TENM2Q9NT68 2774 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A0B4J2C4 111 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1B0GWB2 263 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCR3O14931 201 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPAN13O95857 204 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 COX17Q14061 63 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q6ZR54 194 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.53□□□□□ -1.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 F8WDY8 70 aa3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSMB2P49721 201 aa3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 GAGE2BQ13066 116 aa3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 VAMP3Q15836 100 aa3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms