RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 CELA1Q9UNI1 258 aa7.48□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 K7EQD1 137 aa7.48□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 Q6ZSN1 163 aa7.48□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 CENPEQ02224 2701 aa7.48□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 C10orf25Q5T742 122 aa7.48□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 JMJD1CQ15652 2540 aa7.48□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 USMG5Q96IX5 58 aa7.47□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 LAMA5O15230 3695 aa7.47□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 SMIM29Q86T20 159 aa7.47□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.47□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 KLK9Q2XQG4 91 aa7.46□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 LINC00575Q6W349 94 aa7.46□□□□□ -1.21
SEMA4B-204ENST00000558065 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.46□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 H3BUX3 64 aa7.45□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 MUC3AQ02505 3323 aa7.45□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.45□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 ODF3BA8MYP8 253 aa7.44□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF292O60281 2723 aa7.44□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 C3orf84H3BNL1 204 aa7.44□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 IGHV3-53P01767 116 aa7.44□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 KIAA0087Q14695 138 aa7.44□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 COL12A1Q99715 3063 aa7.43□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 MP68P56378 58 aa7.43□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 C6orf99Q4VX62 202 aa7.42□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 B9D2Q9BPU9 175 aa7.42□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.42□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.42□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.41□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 DEFB131AP59861 70 aa7.41□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.41□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 B4DSR2 109 aa7.41□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 Q9BRP9 147 aa7.41□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 ACANP16112 2415 aa7.4□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SEMA4B-204ENST00000558065 LINC00208Q96KT6 92 aa7.4□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 ATMQ13315 3056 aa7.4□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 LMO4P61968 165 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 A8MTW9 85 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 Q6ZQY7 126 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 AKAP13Q12802 2813 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 FSHBP01225 129 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 PRM2P04554 102 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 CR1P17927 2039 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 COX7BP24311 80 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 NDUFB1O75438 58 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 H0Y9J4 135 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 Q8NDZ9 215 aa7.35□□□□□ -1.23
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SEMA4B-204ENST00000558065 MSMBP08118 114 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 SPINK7P58062 85 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 INSP01308 110 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 PLA2G2AP14555 144 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA4B-204ENST00000558065 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.34□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 IGHV4-59P01825 116 aa7.34□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 Q8NAQ8 132 aa7.34□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 H3BUA1 57 aa7.32□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.32□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.32□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.32□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 H3BQ85 93 aa7.32□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.32□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.31□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.31□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 CASC2Q6XLA1 102 aa7.31□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.3□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1W2PPR1 153 aa7.3□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.3□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.29□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.28□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.28□□□□□ -1.24
SEMA4B-204ENST00000558065 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.27□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.27□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 DEFB136Q30KP8 78 aa7.26□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 CHD6Q8TD26 2715 aa7.26□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.26□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A0A0MQY5 61 aa7.26□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.26□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 IGLV1-51P01701 117 aa7.25□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1W2PNM2 257 aa7.25□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.25□□□□□ -1.25
SEMA4B-204ENST00000558065 COA5Q86WW8 74 aa7.25□□□□□ -1.25
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