RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PNN7	141 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	PLN	P26678	52 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	CXCL5	P42830	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	HERVK_113	P61574	105 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688		F8WDY8	70 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	LEPROT	O15243	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	LINC00158	P58513	81 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	DAND5	Q8N907	189 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-233	ENST00000552688	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	C20orf202	A1L168	122 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688		J3QQQ9	107 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688		M0QXV9	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	VPREB1	P12018	145 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	NPC2	P61916	151 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688		H0Y9J4	135 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	NMU	P48645	174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688		E9PLD3	99 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	UBE2B	P63146	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	PRR4	Q16378	134 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688		Q8NDZ9	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	LRP2	P98164	4655 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	NCR3	O14931	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688		A0A0J9YXY3	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	HERV-K104	P63124	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	TNXB	P22105	4242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	COX17	Q14061	63 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CS-233	ENST00000552688	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	PRY	O14603	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	AKR1D1	P51857	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	ZNF861P	O60384	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	LITAF	Q99732	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	PRLH	P81277	87 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CS-233	ENST00000552688		A0A0A0MQY5	61 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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