RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 Q8NDZ9 215 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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CS-229ENST00000551936 TMEM238C9JI98 176 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 SFTA2Q6UW10 78 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 MUC2Q02817 5179 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 TMEM223A0PJW6 202 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 M0R378 163 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 PRLHP81277 87 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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CS-229ENST00000551936 HIST1H2BJP06899 126 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 HIST1H2BOP23527 126 aa8.44□□□□□ -1.06
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CS-229ENST00000551936 HIST1H2BDP58876 126 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 HIST1H2BCP62807 126 aa8.44□□□□□ -1.06
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CS-229ENST00000551936 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.44□□□□□ -1.06
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CS-229ENST00000551936 LINC00158P58513 81 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 HSBP1O75506 76 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 MUC17Q685J3 4493 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 A0A0U1RRA0 63 aa8.41□□□□□ -1.06
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CS-229ENST00000551936 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-229ENST00000551936 SMIM13P0DJ93 91 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 CTAG1AP78358 180 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 HERV-K104P63124 156 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 LEPROTL1O95214 131 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 SPRR1AP35321 89 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-229ENST00000551936 SPRR4Q96PI1 79 aa8.34□□□□□ -1.07
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CS-229ENST00000551936 PRYO14603 147 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 NCR3O14931 201 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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CS-229ENST00000551936 S100A6P06703 90 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 LEPROTO15243 131 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 TPRXLQ17RH7 258 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-229ENST00000551936 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-229ENST00000551936 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-229ENST00000551936 DAND5Q8N907 189 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 CDIP1Q9H305 208 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 PLNP26678 52 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 S100A2P29034 98 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 B5MCH6 92 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 J3QQQ9 107 aa8.25□□□□□ -1.09
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CS-229ENST00000551936 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.24□□□□□ -1.09
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CS-229ENST00000551936 IGKCP01834 107 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 DDTP30046 118 aa8.24□□□□□ -1.09
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CS-229ENST00000551936 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 NMUP48645 174 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 HERVK_113P61574 105 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 S100A12P80511 92 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 Q8NBF4 154 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-229ENST00000551936 ERC2-IT1O76042 136 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-229ENST00000551936 C3orf79P0CE67 100 aa8.22□□□□□ -1.09
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