RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WYN8 130 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GU69 56 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N814 137 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRBP23467 1997 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 EML5Q05BV3 1969 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZSN1 163 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 UQCR11O14957 56 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 COX17Q14061 63 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf25Q5T742 122 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 LUZP6Q538Z0 58 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZTC4 211 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 SORL1Q92673 2214 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGIPA6NJ69 53 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 NACAE9PAV3 2078 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV2-11P01706 119 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZPA2 131 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM29Q86T20 159 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 M0QY20 66 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 COA5Q86WW8 74 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 POLQO75417 2590 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 CRIP1P50238 77 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB1P60022 68 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZRP5 223 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 PRAC1Q96KF2 57 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 Q8IZM0 81 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 LAMA3Q16787 3333 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GUV1 79 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRB-210ENST00000551525 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 PLXNB1O43157 2135 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 Q5VV11 94 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZQT0 140 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 Q9BRP9 147 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 CASC10Q5T4H9 136 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 MOBPQ13875 183 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 DMAC1Q96GE9 116 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 KLK9Q2XQG4 91 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 A6NN06 94 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00575Q6W349 94 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 A0A096LNT2 108 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 ACYP2P14621 99 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRB-210ENST00000551525 CHTF8P0CG12 524 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRB-210ENST00000551525 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 PCOTHQ58A44 107 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 K7EIL1 84 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 GAS8-AS1O95177 125 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 TSHBP01222 138 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 AGRNO00468 2067 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 CSAG1Q6PB30 78 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 CDH23Q9H251 3354 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf137Q5JT78 98 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 ACANP16112 2415 aa4.29□□□□□ -1.72
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