RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 Q8NDZ9 215 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 HBDP02042 147 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00614P0C842 121 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 SFTA2Q6UW10 78 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 BAGE3Q86Y29 109 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 SEC11CQ9BY50 192 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A096LNJ9 63 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 C11orf86A6NJI1 115 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 ATP6V1G1O75348 118 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 CTAG1AP78358 180 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 SPRR4Q96PI1 79 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 DAND5Q8N907 189 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 NCR3O14931 201 aa6.92□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 RHEBQ15382 184 aa6.92□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.92□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 COMMD7Q86VX2 200 aa6.92□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.92□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 Q8NBF4 154 aa6.92□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 SMIM13P0DJ93 91 aa6.91□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.9□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 PRYO14603 147 aa6.9□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.9□□□□□ -1.3
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM223A0PJW6 202 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 S100A12P80511 92 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 IFITM2Q01629 132 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.87□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.87□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.87□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 SPINK1P00995 79 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00587B1AMM8 73 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 SPRR1AP35321 89 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 HERV-K104P63124 156 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 H0Y8G0 127 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 MOBPQ13875 183 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSP2-205ENST00000549039 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 APOC3P02656 99 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00483Q53H64 154 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.82□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 B5MCH6 92 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 DDTP30046 118 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 HSBP1O75506 76 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 ERC2-IT1O76042 136 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 NDUFA5Q16718 116 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 SNAPINO95295 136 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 SVBPQ8N300 66 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 Q8N377 158 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A20O43772 301 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 Q9BRP9 147 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 Q6ZRX8 168 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 LEPROTO15243 131 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 J3QQQ9 107 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 LEPROTL1O95214 131 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 PLNP26678 52 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 HERVK_113P61574 105 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 NPC2P61916 151 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 NDUFC2O95298 119 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 IGLV6-57P01721 117 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 FABP4P15090 132 aa6.72□□□□□ -1.33
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