RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCR3-208	ENST00000545097	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CCR3-208	ENST00000545097	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCR3-208	ENST00000545097	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1W2PNN7	141 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	PCP4	P48539	62 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	FXYD2	P54710	66 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1W2PPM0	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	PLN	P26678	52 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		F8VRH5	84 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		K7EMI3	77 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	CEND1	Q8N111	149 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		A0A087WZ39	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	FAM168B	A1KXE4	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	TAL2	Q16559	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		B5MCH6	92 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		K7ERJ3	54 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		K7ERU9	68 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	FABP2	P12104	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		Q6ZRP5	223 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	APOM	O95445	188 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	TIMM17A	Q99595	171 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097		E9PLD3	99 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	VCX2	Q9H322	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCR3-208	ENST00000545097	LINC01549	A6NIU2	74 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1B0GWB2	263 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	NDUFA1	O15239	70 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	SPINK8	P0C7L1	97 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	PMVK	Q15126	192 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		5	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	HERVK_113	P61574	105 aa		5	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	HERVK_113	P63121	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097		Q8IZM0	81 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097		F8W1H4	67 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097		H3BMG7	143 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.96	□□□□□ -1.61

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