RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 C5orf47Q569G3 176 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087WYN8 130 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 YPEL4Q96NS1 127 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00167Q96N53 147 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 SCXQ7RTU7 201 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 APLNQ9ULZ1 77 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 TAX1BP3O14907 124 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 WFDC2Q14508 124 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087WSZ3 146 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 A8MTW9 85 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 CHTF8P0CG12 524 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 Q8NBF4 154 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N814 137 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 ATOX1O00244 68 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 BCE1O60756 84 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00643Q86TS7 51 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF292O60281 2723 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 ENHOQ6UWT2 76 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 LCE6AA0A183 80 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 PRR15LQ9BU68 103 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 hDV103S1A0JD37 113 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0U1RQV1 116 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N3U1 123 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF575Q86XF7 245 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 A0A096LNJ9 63 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV2-30P06310 120 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 TNP2Q05952 138 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 Q9UF83 564 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 BPTFQ12830 3046 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 WIPF1O43516 503 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00575Q6W349 94 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 CHD6Q8TD26 2715 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01546A6NGU7 62 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF861PO60384 105 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00310P59036 64 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 SERP2Q8N6R1 65 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 SPINK1P00995 79 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00313P59037 77 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 Q96NJ1 140 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 HTTP42858 3142 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 PRR34Q9NV39 138 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZRX8 168 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV7-43P04211 117 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 M0R2T5 61 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 KIAA0087Q14695 138 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 HCG22E2RYF7 251 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 TRANK1O15050 2925 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00208Q96KT6 92 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 CR1P17927 2039 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 V9GYY9 64 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 C20orf197Q8N268 126 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 C8orf87E5RJ46 101 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.78□□□□□ -1.32
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