RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ATRXP46100 2492 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZRX8 168 aa6.4□□□□□ -1.39
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PTPRB-204ENST00000538708 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-204ENST00000538708 PMAIP1Q13794 54 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-204ENST00000538708 SPRR4Q96PI1 79 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GVX0 72 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-204ENST00000538708 JMJD1CQ15652 2540 aa6.11□□□□□ -1.43
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