RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABCA4P78363 2273 aa4.19□□□□□ -1.74
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.18□□□□□ -1.74
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 H3BSH0 61 aa4.18□□□□□ -1.74
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COX7BP24311 80 aa4.18□□□□□ -1.74
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TNCP24821 2201 aa4.18□□□□□ -1.74
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.17□□□□□ -1.74
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PNN7 141 aa4.17□□□□□ -1.74
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 C14orf177Q52M58 125 aa4.12□□□□□ -1.75
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.02□□□□□ -1.77
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP1-1Q07627 177 aa4□□□□□ -1.77
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIGYQ3MUY2 71 aa4□□□□□ -1.77
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4□□□□□ -1.77
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CACNA1EQ15878 2313 aa4□□□□□ -1.77
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 KNL1Q8NG31 2342 aa3.99□□□□□ -1.77
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GAS8-AS1O95177 125 aa3.99□□□□□ -1.77
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRB1P04280 392 aa3.99□□□□□ -1.77
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIOO75962 3097 aa3.97□□□□□ -1.77
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LY6G6CO95867 125 aa3.97□□□□□ -1.77
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.97□□□□□ -1.77
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAMA1P25391 3075 aa3.96□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q8N9L7 120 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.94□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.94□□□□□ -1.78
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.94□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MED13LQ71F56 2210 aa3.94□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.93□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 M0R2N4 97 aa3.93□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV2D-28P01615 120 aa3.93□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.93□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CACNA1CQ13936 2221 aa3.93□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.92□□□□□ -1.78
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.9□□□□□ -1.79
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00575Q6W349 94 aa3.9□□□□□ -1.79
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.9□□□□□ -1.79
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